40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1925 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1925  putative smp protein  100 
 
 		 207 aa  419  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03373  hypothetical protein  70.15 
 
 		 201 aa  286  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002633  Smp-like protein  74.01 
 
 		 179 aa  270  9e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0623  peripheral membrane protein  47.7 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.454122  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  28.26 
 
 		 562 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3611  conserved hypothetical protein  28.26 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04228  hypothetical protein  28.26 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4934  hypothetical protein  28.26 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.921583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4936  hypothetical protein  28.26 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.835415 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3669  hypothetical protein  28.26 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.891572  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4986  hypothetical protein  28.26 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4622  hypothetical protein  28.26 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04263  hypothetical protein  28.26 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4935  hypothetical protein  29.2 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4901  hypothetical protein  29.2 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4828  hypothetical protein  29.2 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4987  hypothetical protein  29.2 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0548  hypothetical protein  27.62 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4989  hypothetical protein  29.2 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0451  hypothetical protein  27.62 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0893535  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0546  hypothetical protein  26.09 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0805986 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3587  hypothetical protein  26.94 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0686  aphA-like regulator  27.78 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000629381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3468  hypothetical protein  28.99 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0665  hypothetical protein  30.65 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2447  hypothetical protein  24.74 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0306479  normal  0.0484765 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0827  hypothetical protein  28.26 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3494  hypothetical protein  27.72 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3623  hypothetical protein  27.72 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1222  hypothetical protein  27.78 
 
 		 407 aa  48.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1106  membrane protein  27.78 
 
 		 406 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1045  membrane protein  27.78 
 
 		 394 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000754815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1041  membrane protein  27.78 
 
 		 406 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.66781  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2818  membrane protein  25.44 
 
 		 343 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1006  membrane protein  25.73 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1144  membrane protein  25.69 
 
 		 356 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3362  membrane protein  25.69 
 
 		 353 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.019769 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3224  membrane protein  25.69 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3223  membrane protein  25.69 
 
 		 344 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3044  membrane protein  25.88 
 
 		 370 aa  41.6  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>