24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1106 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1041  membrane protein  93.84 
 
 		 406 aa  729    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.66781  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1106  membrane protein  100 
 
 		 406 aa  807    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1045  membrane protein  84.07 
 
 		 394 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000754815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1222  hypothetical protein  77.54 
 
 		 407 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2818  membrane protein  75.67 
 
 		 343 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3223  membrane protein  56.27 
 
 		 344 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3362  membrane protein  56.16 
 
 		 353 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.019769 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3224  membrane protein  88.18 
 
 		 356 aa  358  7e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1144  membrane protein  88.18 
 
 		 356 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3374  membrane protein  78.74 
 
 		 248 aa  349  5e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3044  membrane protein  77.34 
 
 		 370 aa  342  7e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2811  membrane protein  71.88 
 
 		 244 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000304796 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3545  membrane protein  74.42 
 
 		 221 aa  322  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0977  membrane protein  62.28 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0130473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1006  membrane protein  61.9 
 
 		 230 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1031  membrane protein  53.85 
 
 		 198 aa  221  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3587  hypothetical protein  24.23 
 
 		 226 aa  49.7  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0546  hypothetical protein  27.89 
 
 		 214 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0805986 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0451  hypothetical protein  24.58 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0893535  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03373  hypothetical protein  27.46 
 
 		 201 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1108  hypothetical protein  25 
 
 		 230 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0548  hypothetical protein  24.37 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1925  putative smp protein  27.01 
 
 		 207 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3468  hypothetical protein  27.72 
 
 		 223 aa  43.1  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>