21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1144 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1144  membrane protein  100 
 
 		 356 aa  719    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3362  membrane protein  96.63 
 
 		 353 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.019769 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3223  membrane protein  97.38 
 
 		 344 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3224  membrane protein  96.63 
 
 		 356 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2818  membrane protein  85.67 
 
 		 343 aa  529  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1222  hypothetical protein  58.35 
 
 		 407 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1045  membrane protein  59.95 
 
 		 394 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000754815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1041  membrane protein  57.63 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.66781  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1106  membrane protein  56.9 
 
 		 406 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3374  membrane protein  75.71 
 
 		 248 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3044  membrane protein  76.35 
 
 		 370 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2811  membrane protein  67.23 
 
 		 244 aa  325  7e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000304796 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3545  membrane protein  70 
 
 		 221 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0977  membrane protein  76.42 
 
 		 274 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0130473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1006  membrane protein  59.47 
 
 		 230 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1031  membrane protein  56.72 
 
 		 198 aa  229  6e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1108  hypothetical protein  25.81 
 
 		 230 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3587  hypothetical protein  22.37 
 
 		 226 aa  52.8  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0451  hypothetical protein  22.83 
 
 		 232 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0893535  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0546  hypothetical protein  26.88 
 
 		 214 aa  47  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0805986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0548  hypothetical protein  22 
 
 		 232 aa  43.1  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>