17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1031 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1031  membrane protein  100 
 
 		 198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1006  membrane protein  71.43 
 
 		 230 aa  288  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3374  membrane protein  55.9 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2811  membrane protein  58.79 
 
 		 244 aa  234  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000304796 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3044  membrane protein  56.02 
 
 		 370 aa  226  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1222  hypothetical protein  54.87 
 
 		 407 aa  222  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1041  membrane protein  53.85 
 
 		 406 aa  221  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.66781  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1106  membrane protein  53.85 
 
 		 406 aa  220  9e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0977  membrane protein  63.58 
 
 		 274 aa  220  9e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0130473 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1045  membrane protein  53.85 
 
 		 394 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000754815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3545  membrane protein  55.38 
 
 		 221 aa  219  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086416 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1144  membrane protein  57.95 
 
 		 356 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3362  membrane protein  57.95 
 
 		 353 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.019769 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3224  membrane protein  57.95 
 
 		 356 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3223  membrane protein  57.95 
 
 		 344 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2818  membrane protein  57.06 
 
 		 343 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1108  hypothetical protein  24.88 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>