More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_15660 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_15660  oxidoreductase  100 
 
 
331 aa  658    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0446375  hitchhiker  1.47044e-16 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  59.88 
 
 
332 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.88 
 
 
332 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  58.97 
 
 
332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  45.97 
 
 
339 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.45 
 
 
333 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  45.76 
 
 
333 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  45.15 
 
 
333 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 
333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.92 
 
 
338 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  47.92 
 
 
338 aa  281  9e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.62 
 
 
338 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.6 
 
 
335 aa  277  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.21 
 
 
337 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  44.71 
 
 
334 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  44.61 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  44.11 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2291  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.62 
 
 
338 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.312969 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.92 
 
 
338 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  47.92 
 
 
338 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  47.92 
 
 
338 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.55 
 
 
334 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.94 
 
 
335 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  42.51 
 
 
344 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.42 
 
 
334 aa  271  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.96 
 
 
344 aa  269  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  43.64 
 
 
386 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.87 
 
 
341 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3312  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.87 
 
 
342 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5531  alcohol dehydrogenase  47.02 
 
 
338 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3707  alcohol dehydrogenase  47.02 
 
 
338 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.226872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.4 
 
 
344 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  40.6 
 
 
343 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.34 
 
 
341 aa  259  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.62 
 
 
341 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3174  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.27 
 
 
342 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2188  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.357964  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  43.62 
 
 
340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  42.73 
 
 
338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25100  predicted NADP-dependent oxidoreductase  44.48 
 
 
340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2565  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.42 
 
 
338 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164505  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  40 
 
 
346 aa  253  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4889  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.94 
 
 
347 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6181  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.92 
 
 
338 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128263 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1786  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.74 
 
 
334 aa  249  7e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.88 
 
 
345 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  42.6 
 
 
332 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.86 
 
 
332 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.74 
 
 
337 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.7 
 
 
349 aa  246  3e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.1 
 
 
345 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.72 
 
 
339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0941  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.35 
 
 
406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  40.36 
 
 
345 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0247  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.35 
 
 
338 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1442  putative oxidoreductase/dehydrogenase  42.64 
 
 
340 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17984  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1674  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.91 
 
 
332 aa  245  8e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568438  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06817  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_7G04530)  43.48 
 
 
353 aa  245  9e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.369571 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2648  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.05 
 
 
422 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.47 
 
 
349 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1628  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.35 
 
 
469 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.35 
 
 
427 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2509  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.05 
 
 
338 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  41.99 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.99 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2927  alcohol dehydrogenase  46.36 
 
 
334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0284  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.35 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  38.81 
 
 
345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0525  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.54 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  38.51 
 
 
345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  39.82 
 
 
342 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.42 
 
 
338 aa  242  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 
341 aa  242  6e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  38.51 
 
 
345 aa  242  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  38.51 
 
 
345 aa  242  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  40.36 
 
 
345 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.32 
 
 
341 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.74 
 
 
336 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.64 
 
 
334 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2257  alcohol dehydrogenase  39.04 
 
 
333 aa  240  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 
332 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2218  alcohol dehydrogenase  39.04 
 
 
333 aa  240  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  41.67 
 
 
348 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40 
 
 
332 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.05 
 
 
344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.44 
 
 
336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  41.64 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  38.21 
 
 
345 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4220  alcohol dehydrogenase  43.11 
 
 
347 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  38.21 
 
 
345 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.87 
 
 
341 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.209407 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  39.29 
 
 
344 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4094  alcohol dehydrogenase  41.96 
 
 
347 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1778  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  44.14 
 
 
345 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.6 
 
 
340 aa  238  9e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1691  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.84 
 
 
345 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.415717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  41.49 
 
 
347 aa  238  9e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0259  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.84 
 
 
345 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1275  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  43.84 
 
 
345 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0318  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  43.84 
 
 
345 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>