33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_5118 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_5118  predicted protein  100 
 
 
236 aa  484  1e-136  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.214309 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16065  predicted protein  38.56 
 
 
252 aa  160  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28646  predicted protein  37.15 
 
 
254 aa  159  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0803186 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00460  35S primary transcript processing-related protein, putative  40.6 
 
 
243 aa  154  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05443  UPF0023 family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G13530)  37.38 
 
 
343 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0437921 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0430  putative RNA-associated protein  30.18 
 
 
228 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0113628 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1364  putative RNA-associated protein  31.58 
 
 
232 aa  106  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.916259  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0935  putative RNA-associated protein  33.9 
 
 
232 aa  103  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1383  putative RNA-associated protein  32.77 
 
 
232 aa  102  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1794  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  29.24 
 
 
233 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216048  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0849  putative RNA-associated protein  31.69 
 
 
241 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1935  putative RNA-associated protein  31.43 
 
 
232 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1340  putative RNA-associated protein  33.33 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  hitchhiker  0.00307869 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0838  putative RNA-associated protein  31.07 
 
 
232 aa  99  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.616695  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0180  putative RNA-associated protein  26.58 
 
 
233 aa  98.6  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2806  putative RNA-associated protein  30 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.216017  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3314  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  29.51 
 
 
241 aa  96.7  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.378274  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0075  putative RNA-associated protein  28.39 
 
 
232 aa  95.1  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00402818  normal  0.0125546 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1821  putative RNA-associated protein  27.98 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1708  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  28.5 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1263  putative RNA-associated protein  27.6 
 
 
234 aa  91.7  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1677  putative RNA-associated protein  28.4 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2283  putative RNA-associated protein  28.57 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2504  putative RNA-associated protein  27.38 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2402  Shwachman-Bodian-Diamond syndrome protein  28.65 
 
 
241 aa  89  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.595665  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2525  putative RNA-associated protein  26.79 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.590746  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0198  putative RNA-associated protein  30.77 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0185659  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0703  putative RNA-associated protein  28.4 
 
 
234 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343486  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1423  putative RNA-associated protein  28.4 
 
 
234 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.088354  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1252  putative RNA-associated protein  28.4 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0197  putative RNA-associated protein  26.22 
 
 
230 aa  85.9  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000236585  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0184  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  26.67 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0583  putative RNA-associated protein  26.95 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>