33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0180 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0180  putative RNA-associated protein  100 
 
 		 233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1263  putative RNA-associated protein  71.67 
 
 		 234 aa  358  4e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1252  putative RNA-associated protein  71.67 
 
 		 234 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0703  putative RNA-associated protein  71.24 
 
 		 234 aa  354  5.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343486  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1423  putative RNA-associated protein  70.39 
 
 		 234 aa  351  5.9999999999999994e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.088354  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1821  putative RNA-associated protein  49.14 
 
 		 234 aa  254  7e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1677  putative RNA-associated protein  46.12 
 
 		 233 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2283  putative RNA-associated protein  48.05 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2525  putative RNA-associated protein  46.12 
 
 		 234 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.590746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0184  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  49.57 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1364  putative RNA-associated protein  48.05 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.916259  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1340  putative RNA-associated protein  44.21 
 
 		 233 aa  231  9e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  hitchhiker  0.00307869 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0197  putative RNA-associated protein  45.65 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000236585  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3314  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  42.92 
 
 		 241 aa  221  9e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.378274  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1708  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  42.92 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2504  putative RNA-associated protein  46.09 
 
 		 230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0849  putative RNA-associated protein  39.48 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2402  Shwachman-Bodian-Diamond syndrome protein  39.48 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.595665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2806  putative RNA-associated protein  38.2 
 
 		 241 aa  207  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.216017  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1794  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  42.86 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216048  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0075  putative RNA-associated protein  44.2 
 
 		 232 aa  201  8e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00402818  normal  0.0125546 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0430  putative RNA-associated protein  43.5 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0113628 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0583  putative RNA-associated protein  42.15 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0935  putative RNA-associated protein  37.78 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0838  putative RNA-associated protein  39.11 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.616695  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1935  putative RNA-associated protein  36.44 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1383  putative RNA-associated protein  37.33 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0198  putative RNA-associated protein  33.33 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0185659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5118  predicted protein  26.58 
 
 		 236 aa  98.6  8e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.214309 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16065  predicted protein  28.4 
 
 		 252 aa  81.6  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28646  predicted protein  25.68 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0803186 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00460  35S primary transcript processing-related protein, putative  26.32 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05443  UPF0023 family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G13530)  25.6 
 
 		 343 aa  52.8  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0437921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>