33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0184 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0184  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1677  putative RNA-associated protein  53.88 
 
 		 233 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2283  putative RNA-associated protein  54.11 
 
 		 231 aa  268  7e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1821  putative RNA-associated protein  53.02 
 
 		 234 aa  265  5.999999999999999e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1364  putative RNA-associated protein  52.81 
 
 		 232 aa  257  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.916259  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0197  putative RNA-associated protein  52.17 
 
 		 230 aa  254  9e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000236585  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2504  putative RNA-associated protein  53.48 
 
 		 230 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0180  putative RNA-associated protein  49.57 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2525  putative RNA-associated protein  47.83 
 
 		 234 aa  234  7e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.590746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1340  putative RNA-associated protein  48.28 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  hitchhiker  0.00307869 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1252  putative RNA-associated protein  45.69 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2402  Shwachman-Bodian-Diamond syndrome protein  47.03 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.595665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1423  putative RNA-associated protein  46.12 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.088354  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1263  putative RNA-associated protein  45.69 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0703  putative RNA-associated protein  45.26 
 
 		 234 aa  224  7e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343486  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3314  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  46.19 
 
 		 241 aa  224  9e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.378274  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1708  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  45.76 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0849  putative RNA-associated protein  43.78 
 
 		 241 aa  221  6e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2806  putative RNA-associated protein  44.49 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.216017  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0935  putative RNA-associated protein  44.59 
 
 		 232 aa  205  6e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1383  putative RNA-associated protein  45.5 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0838  putative RNA-associated protein  45.95 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.616695  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1935  putative RNA-associated protein  43.3 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0583  putative RNA-associated protein  44.84 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1794  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  41.56 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216048  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0075  putative RNA-associated protein  41.85 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00402818  normal  0.0125546 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0198  putative RNA-associated protein  40.81 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0185659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0430  putative RNA-associated protein  37.28 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0113628 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28646  predicted protein  31.73 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0803186 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5118  predicted protein  26.67 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.214309 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16065  predicted protein  25.73 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00460  35S primary transcript processing-related protein, putative  24.55 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05443  UPF0023 family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G13530)  23.66 
 
 		 343 aa  49.7  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0437921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>