31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16065 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_16065  predicted protein  100 
 
 
252 aa  522  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5118  predicted protein  38.56 
 
 
236 aa  160  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.214309 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00460  35S primary transcript processing-related protein, putative  36.82 
 
 
243 aa  149  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28646  predicted protein  36.44 
 
 
254 aa  145  5e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0803186 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05443  UPF0023 family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G13530)  40.15 
 
 
343 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0437921 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0430  putative RNA-associated protein  28.32 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0113628 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1794  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  30.34 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216048  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0180  putative RNA-associated protein  28.4 
 
 
233 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1383  putative RNA-associated protein  26.95 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0198  putative RNA-associated protein  28.57 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0185659  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0184  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  25.73 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0935  putative RNA-associated protein  27.44 
 
 
232 aa  77  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0838  putative RNA-associated protein  26.83 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.616695  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0075  putative RNA-associated protein  28.4 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00402818  normal  0.0125546 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1364  putative RNA-associated protein  24.14 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.916259  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1677  putative RNA-associated protein  28.3 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1935  putative RNA-associated protein  26.06 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0849  putative RNA-associated protein  25.15 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1821  putative RNA-associated protein  24.58 
 
 
234 aa  72  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0583  putative RNA-associated protein  26.45 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2525  putative RNA-associated protein  25.44 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.590746  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1340  putative RNA-associated protein  27.95 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  hitchhiker  0.00307869 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0703  putative RNA-associated protein  24.85 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343486  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1252  putative RNA-associated protein  24.85 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1423  putative RNA-associated protein  24.85 
 
 
234 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.088354  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3314  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  24.56 
 
 
241 aa  62  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.378274  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2283  putative RNA-associated protein  24.57 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1263  putative RNA-associated protein  24.85 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1708  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  23.98 
 
 
241 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2806  putative RNA-associated protein  23.31 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.216017  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2402  Shwachman-Bodian-Diamond syndrome protein  21.64 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.595665  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>