33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0849 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0849  putative RNA-associated protein  100 
 
 		 241 aa  482  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2806  putative RNA-associated protein  80.91 
 
 		 241 aa  403  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.216017  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1708  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  79.25 
 
 		 241 aa  399  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3314  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  78.84 
 
 		 241 aa  395  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.378274  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2402  Shwachman-Bodian-Diamond syndrome protein  75.1 
 
 		 241 aa  383  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.595665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1364  putative RNA-associated protein  55.79 
 
 		 232 aa  275  5e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.916259  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2504  putative RNA-associated protein  51.29 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0197  putative RNA-associated protein  49.15 
 
 		 230 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000236585  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1677  putative RNA-associated protein  51.72 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2283  putative RNA-associated protein  49.79 
 
 		 231 aa  244  6.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2525  putative RNA-associated protein  51.74 
 
 		 234 aa  241  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.590746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1821  putative RNA-associated protein  48.71 
 
 		 234 aa  240  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1340  putative RNA-associated protein  46.58 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  hitchhiker  0.00307869 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0184  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  43.78 
 
 		 232 aa  221  6e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0180  putative RNA-associated protein  39.48 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1263  putative RNA-associated protein  41.1 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1252  putative RNA-associated protein  40.68 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1423  putative RNA-associated protein  40.25 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.088354  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0703  putative RNA-associated protein  40.25 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343486  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0935  putative RNA-associated protein  38.77 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1794  Ribosome maturation protein SBDS-like protein  36.28 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216048  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0075  putative RNA-associated protein  38.16 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00402818  normal  0.0125546 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0838  putative RNA-associated protein  36.56 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.616695  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1935  putative RNA-associated protein  37.89 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0583  putative RNA-associated protein  37.95 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1383  putative RNA-associated protein  35.68 
 
 		 232 aa  164  9e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0430  putative RNA-associated protein  32.17 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0113628 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0198  putative RNA-associated protein  33.77 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0185659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5118  predicted protein  31.69 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.214309 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28646  predicted protein  30.06 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0803186 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00460  35S primary transcript processing-related protein, putative  26.41 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16065  predicted protein  25.15 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05443  UPF0023 family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G13530)  24.06 
 
 		 343 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0437921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>