More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_36485 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_36485  predicted protein  100 
 
 
334 aa  688    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.568714  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  48.08 
 
 
327 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  41.21 
 
 
461 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  41.77 
 
 
345 aa  248  8e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.8 
 
 
459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  39.87 
 
 
332 aa  242  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  41.48 
 
 
459 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.16 
 
 
459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.16 
 
 
459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  42.26 
 
 
340 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  42.17 
 
 
455 aa  229  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  40.65 
 
 
324 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  43.09 
 
 
469 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  41.16 
 
 
326 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  41.32 
 
 
454 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  39.3 
 
 
455 aa  226  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  39.87 
 
 
324 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  41.53 
 
 
456 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  40.51 
 
 
334 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  37.94 
 
 
479 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  38.46 
 
 
326 aa  225  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.7 
 
 
453 aa  223  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  41.25 
 
 
462 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  40.06 
 
 
325 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  39.55 
 
 
338 aa  223  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40 
 
 
328 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.23 
 
 
479 aa  222  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  40.19 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  42.81 
 
 
456 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  39.87 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.26 
 
 
465 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  39.62 
 
 
463 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  40 
 
 
324 aa  220  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  40.89 
 
 
456 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  40 
 
 
331 aa  219  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.23 
 
 
455 aa  219  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  42.27 
 
 
463 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  40.58 
 
 
456 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  40 
 
 
324 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  36.98 
 
 
457 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  38.26 
 
 
323 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  38.26 
 
 
323 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  41.03 
 
 
460 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.39 
 
 
346 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.1 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  36.66 
 
 
457 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.74 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  40.06 
 
 
463 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.31 
 
 
343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  41.59 
 
 
458 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  40.71 
 
 
456 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  38.98 
 
 
453 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1121  cysteine synthase A  37.06 
 
 
332 aa  209  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  36.59 
 
 
464 aa  209  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  40.84 
 
 
454 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  38.39 
 
 
372 aa  208  8e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.85 
 
 
326 aa  208  9e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  40.56 
 
 
455 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  40 
 
 
494 aa  207  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  40.55 
 
 
468 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  41.21 
 
 
465 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.87 
 
 
496 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  40.87 
 
 
464 aa  206  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  39.68 
 
 
302 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  37.7 
 
 
458 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  39.74 
 
 
457 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.44 
 
 
333 aa  203  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  38.34 
 
 
464 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  39.38 
 
 
461 aa  203  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.34 
 
 
461 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  37.06 
 
 
332 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.46 
 
 
456 aa  202  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  38.41 
 
 
468 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  40.26 
 
 
464 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  38.17 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  39.94 
 
 
355 aa  201  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  40.26 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  38.44 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  40.26 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.1 
 
 
461 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2837  cysteine synthase A  36.91 
 
 
345 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  40.26 
 
 
464 aa  199  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.93 
 
 
307 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  39.23 
 
 
454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2564  cysteine synthase A  37.66 
 
 
345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.544676  normal  0.832918 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1493  cysteine synthase A  36.59 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.464198 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.16 
 
 
352 aa  196  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.816329  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  40.58 
 
 
464 aa  196  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  36.33 
 
 
459 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2553  cysteine synthase A  36.28 
 
 
366 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0093457  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  38.46 
 
 
465 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  38.92 
 
 
464 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  37.06 
 
 
456 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2323  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.76 
 
 
343 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  39.3 
 
 
464 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3927  cysteine synthase A  34.38 
 
 
344 aa  192  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.385733 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.29 
 
 
307 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.94 
 
 
307 aa  192  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  36.74 
 
 
469 aa  191  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  36.91 
 
 
307 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>