72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_26828 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009366  OSTLU_26828  predicted protein  100 
 
 		 257 aa  526  1e-148  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  50.98 
 
 		 925 aa  55.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  50.98 
 
 		 925 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  42.03 
 
 		 388 aa  49.7  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13750  ribonuclease D  36.36 
 
 		 399 aa  48.9  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1391  3'-5' exonuclease  43.4 
 
 		 416 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  40.58 
 
 		 382 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  50 
 
 		 375 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2016  ribonuclease D  50 
 
 		 375 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00169692  normal  0.221518 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1887  3'-5' exonuclease  26.55 
 
 		 418 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448337  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16390  ribonuclease D  44 
 
 		 437 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  38.18 
 
 		 382 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1959  ribonuclease D  48.08 
 
 		 375 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000313579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  48.08 
 
 		 375 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000119147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1500  ribonuclease D  48.08 
 
 		 375 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000854063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1392  3'-5' exonuclease  39.39 
 
 		 406 aa  46.6  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125783  normal  0.298063 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0542  DNA-directed DNA polymerase  48.84 
 
 		 585 aa  46.6  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481022  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1890  3'-5' exonuclease  43.4 
 
 		 404 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2374  ribonuclease D  48 
 
 		 384 aa  46.2  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1470  3'-5' exonuclease  39.13 
 
 		 451 aa  45.8  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  45.83 
 
 		 369 aa  45.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  44 
 
 		 381 aa  45.4  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  35.29 
 
 		 382 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6780  3'-5' exonuclease  38.1 
 
 		 443 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1528  3'-5' exonuclease  39.13 
 
 		 451 aa  45.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104904  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26251  predicted protein  35.44 
 
 		 666 aa  45.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305353  normal  0.554527 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  38.1 
 
 		 611 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  31.67 
 
 		 439 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1937  ribonuclease D  36.62 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  31.08 
 
 		 377 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1726  3'-5' exonuclease  41.07 
 
 		 417 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0339876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2381  3'-5' exonuclease  41.3 
 
 		 407 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135711  hitchhiker  0.000308945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2210  3'-5' exonuclease  45.28 
 
 		 428 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  37.7 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2256  3'-5' exonuclease  45.28 
 
 		 428 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0553877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2199  3'-5' exonuclease  45.28 
 
 		 428 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10077 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1064  ribonuclease D (rnase d)  44 
 
 		 374 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00409138  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  39.68 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  31.08 
 
 		 377 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  44.23 
 
 		 375 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2232  ribonuclease D  36.62 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000142967  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12960  ribonuclease D  41.3 
 
 		 416 aa  43.9  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00837058  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  44.23 
 
 		 371 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2009  ribonuclease D  36.62 
 
 		 403 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  44.23 
 
 		 375 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1582  3'-5' exonuclease  43.48 
 
 		 427 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  0.169535 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  44.23 
 
 		 375 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  44.23 
 
 		 371 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01290  conserved hypothetical protein  41.67 
 
 		 740 aa  43.5  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2479  3'-5' exonuclease  41.38 
 
 		 426 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46942  predicted protein  34.33 
 
 		 788 aa  43.5  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  44.68 
 
 		 382 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  44.23 
 
 		 375 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  44.23 
 
 		 375 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  44.23 
 
 		 375 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1384  ribonuclease D  44.23 
 
 		 375 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0737977  normal  0.865883 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1331  3'-5' exonuclease  39.13 
 
 		 427 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0588384  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24120  ribonuclease D  35.29 
 
 		 413 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108272  decreased coverage  0.00823573 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24216  predicted protein  27.92 
 
 		 614 aa  43.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000105574  normal  0.257182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2759  ribonuclease D  44 
 
 		 390 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000108089  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2388  3'-5' exonuclease  36.25 
 
 		 201 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000109184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5178  3'-5' exonuclease  36 
 
 		 499 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49801  predicted protein  38.6 
 
 		 632 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1761  3'-5' exonuclease  37.74 
 
 		 437 aa  42.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159451  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2402  ribonuclease D  44 
 
 		 373 aa  42.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  43.48 
 
 		 294 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2013  ribonuclease D  44 
 
 		 373 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000328628  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2124  ribonuclease D  44 
 
 		 373 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0137564  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  46 
 
 		 386 aa  42  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 534 aa  42  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  43.48 
 
 		 288 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1994  ribonuclease D  36.62 
 
 		 373 aa  42  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>