248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4195 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4195  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 332 aa  657    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  36.3 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  33.56 
 
 		 356 aa  142  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  31.07 
 
 		 327 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  31.1 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  31.9 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  29.91 
 
 		 357 aa  135  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  32.33 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  30.84 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  33.11 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 347 aa  132  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4441  basic membrane lipoprotein  30.4 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0481892  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  34.02 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  29.02 
 
 		 358 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  32.23 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  29.68 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  31.72 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0010  Bmp family lipoprotein  30.11 
 
 		 368 aa  125  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0007  Bmp family lipoprotein  30.11 
 
 		 368 aa  125  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  29.5 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  34.98 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  30.12 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  29.48 
 
 		 355 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  31.83 
 
 		 334 aa  122  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  29.57 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  28.53 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  29.19 
 
 		 355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  29.19 
 
 		 355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  29.19 
 
 		 355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  29.76 
 
 		 339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  29.19 
 
 		 355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  29.19 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.38 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  28.41 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  29.62 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  31.38 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  33.04 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  29.48 
 
 		 363 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  29.05 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0915  basic membrane lipoprotein  28.52 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  30.12 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  35.25 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  30.8 
 
 		 363 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  30.69 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  28.77 
 
 		 358 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  30.41 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0387  basic membrane protein D (bmpD)  29.43 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  27.81 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  31.37 
 
 		 337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  30.58 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  28.45 
 
 		 361 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  29.47 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  32.92 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  29.55 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0693  ABC transporter periplasmic protein  30.27 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000138325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  27.35 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  26.36 
 
 		 356 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  29.66 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  31.03 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  28.49 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  30.34 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  27.51 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  27.68 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  28.26 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  28.41 
 
 		 370 aa  106  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  32.4 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  31.46 
 
 		 340 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  31.11 
 
 		 354 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  31.35 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  33.09 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  29.46 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  30.25 
 
 		 349 aa  99.4  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0385  basic membrane protein A (bmpA), immunodominant antigen P39  25.5 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  33.22 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  31.99 
 
 		 404 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  31.43 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  31.25 
 
 		 403 aa  97.4  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  27.79 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  31.07 
 
 		 350 aa  96.7  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  29.79 
 
 		 349 aa  96.3  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  28.45 
 
 		 351 aa  95.9  8e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  31.66 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0635  basic membrane lipoprotein  28.02 
 
 		 352 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  31.2 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  29.5 
 
 		 361 aa  94  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  28.32 
 
 		 366 aa  92.8  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  32.91 
 
 		 353 aa  92.8  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0384  basic membrane protein B (bmpB)  25.53 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  32.16 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  32.05 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  28.61 
 
 		 366 aa  90.5  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  30.49 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  30.49 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4008  basic membrane lipoprotein  29.96 
 
 		 327 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0703  basic membrane lipoprotein  27.95 
 
 		 378 aa  89.7  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.183681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2234  basic membrane lipoprotein  31.87 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.511014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0904  basic membrane lipoprotein  30.33 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.455123 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0386  basic membrane protein C (bmpC)  23.37 
 
 		 353 aa  87  4e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  32.29 
 
 		 348 aa  87  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>