173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1695 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1695  putative GAF sensor protein  100 
 
 
330 aa  674    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.37186 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
1741 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
641 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4753  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  23.9 
 
 
557 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.050677  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0918  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  25.43 
 
 
554 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0815  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  25.4 
 
 
768 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.552071  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  29.84 
 
 
153 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.71 
 
 
713 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  29.03 
 
 
153 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  29.03 
 
 
153 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  28.23 
 
 
153 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  27.2 
 
 
153 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5145  PTSINtr with GAF domain, PtsP  25.52 
 
 
759 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.498029  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 
154 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04410  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  24.14 
 
 
759 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210581  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5198  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  25.52 
 
 
759 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4217  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  24.14 
 
 
759 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0320  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  25.52 
 
 
759 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.874945  normal  0.406154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5052  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  25.52 
 
 
759 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0430  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  24.14 
 
 
759 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5284  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  25.52 
 
 
759 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  27.2 
 
 
146 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4842  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  25.52 
 
 
759 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  25.9 
 
 
154 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5377  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  24.83 
 
 
759 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.839628  normal  0.0308961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1756  PTSINtr with GAF domain, PtsP  25.93 
 
 
781 aa  53.1  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0090097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  25.9 
 
 
154 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.92 
 
 
2783 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  25.9 
 
 
154 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  25.9 
 
 
154 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  25.9 
 
 
154 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2479  putative phytochrome sensor protein  28.46 
 
 
189 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  25.9 
 
 
154 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  25.18 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  25.18 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  25.68 
 
 
152 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2760  leucine-responsive transcriptional regulator  28.57 
 
 
158 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  25.18 
 
 
193 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  25.18 
 
 
193 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2905  putative GAF sensor protein  28.26 
 
 
782 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  27.42 
 
 
153 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3845  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  24.67 
 
 
762 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 
1325 aa  50.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  25.18 
 
 
295 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.74 
 
 
934 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3042  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  23.03 
 
 
744 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00619839  normal  0.738534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2864  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  23.03 
 
 
744 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000439505  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2946  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  23.03 
 
 
744 aa  49.3  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00960304  normal  0.595887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
1791 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  24.67 
 
 
165 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  21.94 
 
 
145 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1552  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  22.76 
 
 
780 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  26.96 
 
 
158 aa  48.5  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  25 
 
 
155 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  25.17 
 
 
168 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  25.17 
 
 
168 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  25.17 
 
 
168 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1143  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  22.37 
 
 
744 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0190957  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  25.16 
 
 
145 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  25.17 
 
 
168 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  21.29 
 
 
145 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  23.87 
 
 
145 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2667  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  29.35 
 
 
551 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1332  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  22.37 
 
 
744 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  25.17 
 
 
168 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1399  ATPase  26.47 
 
 
419 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  25 
 
 
373 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  25.17 
 
 
168 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  25.17 
 
 
168 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  25.17 
 
 
168 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3240  transcriptional regulator, AsnC family  24.79 
 
 
146 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.47517  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  24.09 
 
 
152 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  25.17 
 
 
168 aa  47.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  25.81 
 
 
143 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2980  AsnC family transcriptional regulator  24.79 
 
 
146 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  24.79 
 
 
146 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  24.79 
 
 
146 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  25.81 
 
 
143 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  25.81 
 
 
143 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48230  Phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  22.76 
 
 
759 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.492707  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  25.81 
 
 
143 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2404  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  24.82 
 
 
784 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0011664  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1159  AsnC family transcriptional regulator  24.55 
 
 
153 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2042  transcriptional regulator, AsnC family  24.79 
 
 
146 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.600199  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  25.81 
 
 
143 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02677  fused PTS enzyme: PEP-protein phosphotransferase (enzyme I)/GAF domain containing protein  21.66 
 
 
748 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000782292  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0862  PTSINtr with GAF domain, PtsP  21.66 
 
 
748 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264028  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2907  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  25.62 
 
 
146 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2976  fused phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP/GAF domain  21.66 
 
 
748 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000163219  decreased coverage  0.00191611 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3128  PTSINtr with GAF domain, PtsP  21.71 
 
 
744 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000159427  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3196  transcriptional regulator, AsnC family  24.79 
 
 
146 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1185  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  21.71 
 
 
744 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000619187  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1262  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  21.71 
 
 
744 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00847446  normal  0.0851964 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1229  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  21.71 
 
 
744 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00679774  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02638  hypothetical protein  21.66 
 
 
748 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000495879  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3149  fused phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP/GAF domain  21.66 
 
 
748 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0886  fused phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP/GAF domain  21.66 
 
 
748 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000319257  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  24.49 
 
 
166 aa  46.2  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4095  fused phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP/GAF domain  21.66 
 
 
748 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000034293  normal  0.0472053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2975  fused phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP/GAF domain  21.66 
 
 
748 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000036967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>