More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4115 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4115  transposase  100 
 
 		 86 aa  177  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  62.96 
 
 		 342 aa  123  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1434  hypothetical protein  63.86 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  61.45 
 
 		 340 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  61.73 
 
 		 499 aa  116  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3450  hypothetical protein  62.65 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.51037  normal  0.264897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0808  transposase IS116/IS110/IS902  56.63 
 
 		 342 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586145  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  57.83 
 
 		 341 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3955  transposase IS116/IS110/IS902  55.42 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  57.83 
 
 		 343 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8798  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.22 
 
 		 341 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  60.26 
 
 		 341 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  55.42 
 
 		 343 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.79 
 
 		 346 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5032  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.42 
 
 		 338 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  59.04 
 
 		 298 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3485  hypothetical protein  58.54 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.145421 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.56 
 
 		 347 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.01 
 
 		 348 aa  105  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3595  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  91.84 
 
 		 315 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.917263  normal  0.896237 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.32 
 
 		 340 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0804  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  57.5 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796908  hitchhiker  0.00222246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.4 
 
 		 346 aa  104  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.85 
 
 		 344 aa  104  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  53.01 
 
 		 343 aa  103  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  53.01 
 
 		 343 aa  103  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  53.01 
 
 		 343 aa  103  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  53.01 
 
 		 343 aa  103  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  53.01 
 
 		 343 aa  103  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  53.01 
 
 		 343 aa  103  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1017  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.81 
 
 		 342 aa  103  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.81 
 
 		 342 aa  103  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.81 
 
 		 342 aa  103  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0894579  normal  0.267688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3844  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.81 
 
 		 342 aa  103  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.464911  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.5 
 
 		 348 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  57.5 
 
 		 348 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.75 
 
 		 341 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.75 
 
 		 341 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  51.81 
 
 		 343 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8455  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.67 
 
 		 333 aa  100  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60.24 
 
 		 338 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.62 
 
 		 343 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.62 
 
 		 343 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0803  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.01 
 
 		 340 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.4 
 
 		 350 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8011  transposase protein  59.04 
 
 		 285 aa  97.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0203844  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.4 
 
 		 350 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  50 
 
 		 342 aa  97.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  50 
 
 		 342 aa  97.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.4 
 
 		 350 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.4 
 
 		 350 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.4 
 
 		 350 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  51.85 
 
 		 338 aa  97.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  51.85 
 
 		 338 aa  97.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  51.85 
 
 		 338 aa  97.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  50.62 
 
 		 337 aa  97.1  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  50.62 
 
 		 337 aa  97.1  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  51.85 
 
 		 338 aa  96.7  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  51.85 
 
 		 338 aa  96.7  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0504  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.15 
 
 		 337 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0754  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.15 
 
 		 337 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0914  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.15 
 
 		 337 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.694774 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3024  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.15 
 
 		 337 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.923031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  51.85 
 
 		 338 aa  96.7  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0834  transposase IS116/IS110/IS902  50.6 
 
 		 343 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220678  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3216  transposase IS116/IS110/IS902  52.05 
 
 		 385 aa  93.6  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0485  putative transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 		 332 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0324291  normal  0.781699 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4841  hypothetical protein  45.68 
 
 		 265 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.160806 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.85 
 
 		 338 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  48.15 
 
 		 341 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  48.15 
 
 		 341 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2519  transposase  51.22 
 
 		 209 aa  92  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0829328  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  50.62 
 
 		 338 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  49.38 
 
 		 343 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3762  putative transposase  53.09 
 
 		 341 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.915156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0928  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.91 
 
 		 337 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2273  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.91 
 
 		 337 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.508057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.91 
 
 		 337 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3552  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.91 
 
 		 337 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.91 
 
 		 337 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  47.56 
 
 		 341 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0488  putative transposase IS116/IS110/IS902  46.91 
 
 		 341 aa  88.6  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.19 
 
 		 337 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.62 
 
 		 356 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3127  hypothetical protein  53.85 
 
 		 166 aa  88.2  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.38 
 
 		 338 aa  88.2  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.38 
 
 		 338 aa  88.2  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.571197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  46.34 
 
 		 341 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1748  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.43 
 
 		 355 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.43 
 
 		 355 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.688347  normal  0.139029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.43 
 
 		 355 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.509366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4212  transposase  49.3 
 
 		 166 aa  87.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  46.34 
 
 		 341 aa  87  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18390  Transposase IS116/IS110/IS902 family  45.68 
 
 		 341 aa  87  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2240  transposase, IS1111 family  51.95 
 
 		 339 aa  87  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000963569  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3882  transposase, IS1111 family  51.95 
 
 		 339 aa  87  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1280  rmpB-like protein  43.37 
 
 		 303 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.37 
 
 		 341 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.37 
 
 		 341 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.37 
 
 		 341 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>