More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3127 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3127  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  336  9e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5572  transposase IS116/IS110/IS902  75.28 
 
 		 338 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  68.54 
 
 		 338 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  67.42 
 
 		 338 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  67.42 
 
 		 338 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.571197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  68.54 
 
 		 341 aa  136  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2519  transposase  67.42 
 
 		 209 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0829328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  67.42 
 
 		 341 aa  133  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  67.42 
 
 		 341 aa  132  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  61.8 
 
 		 338 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4956  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  61.8 
 
 		 341 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0488  putative transposase IS116/IS110/IS902  60.67 
 
 		 341 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  62.5 
 
 		 340 aa  117  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.81 
 
 		 344 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.06 
 
 		 341 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.06 
 
 		 341 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2163  transposase for insertion sequence element IS1111A  35.78 
 
 		 236 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.93 
 
 		 499 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.11 
 
 		 347 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.81 
 
 		 346 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1280  rmpB-like protein  54.95 
 
 		 303 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0804  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  37.99 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796908  hitchhiker  0.00222246 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.01 
 
 		 338 aa  101  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.93 
 
 		 338 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  51.11 
 
 		 343 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.31 
 
 		 343 aa  97.4  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.31 
 
 		 343 aa  97.4  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  47.73 
 
 		 338 aa  96.7  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  47.73 
 
 		 338 aa  97.1  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  47.73 
 
 		 338 aa  96.7  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4212  transposase  51.25 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  47.73 
 
 		 338 aa  95.5  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  47.73 
 
 		 338 aa  95.5  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.44 
 
 		 338 aa  95.5  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  47.73 
 
 		 338 aa  95.5  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  50.6 
 
 		 338 aa  94.7  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.78 
 
 		 338 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 340 aa  94  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.78 
 
 		 338 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3079  transposase IS116/IS110/IS902  50.6 
 
 		 337 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3085  transposase IS116/IS110/IS902  50.6 
 
 		 337 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1434  hypothetical protein  53.01 
 
 		 101 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.78 
 
 		 338 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.78 
 
 		 338 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  47.73 
 
 		 341 aa  92  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  47.73 
 
 		 341 aa  92  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  46.15 
 
 		 298 aa  92  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  47.19 
 
 		 338 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.19 
 
 		 338 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3450  hypothetical protein  53.01 
 
 		 101 aa  91.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.51037  normal  0.264897 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  44.94 
 
 		 338 aa  90.9  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  44.94 
 
 		 338 aa  90.9  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  44.94 
 
 		 338 aa  90.9  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  44.94 
 
 		 338 aa  90.9  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.59 
 
 		 342 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  47.19 
 
 		 340 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.7 
 
 		 338 aa  89  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.7 
 
 		 338 aa  89  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.7 
 
 		 338 aa  89  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.7 
 
 		 338 aa  89  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.7 
 
 		 338 aa  89  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.7 
 
 		 338 aa  89  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.7 
 
 		 338 aa  89  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.7 
 
 		 338 aa  89  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  49.38 
 
 		 341 aa  87.8  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 355 aa  87.4  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.509366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 355 aa  87.4  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.688347  normal  0.139029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5032  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.6 
 
 		 338 aa  87.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1748  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 355 aa  87.4  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.91 
 
 		 350 aa  87.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.91 
 
 		 350 aa  87.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.91 
 
 		 350 aa  87.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.91 
 
 		 350 aa  87.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0853  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.78 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3847  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.78 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.14 
 
 		 302 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0375  putative transposase  48.54 
 
 		 345 aa  87  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.72 
 
 		 350 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  59.7 
 
 		 322 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0384  putative transposase  48.54 
 
 		 365 aa  87  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0381  putative transposase  48.54 
 
 		 365 aa  87  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2242  transposase family protein  41.3 
 
 		 455 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860997  normal  0.210427 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4841  hypothetical protein  45.78 
 
 		 265 aa  85.5  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.160806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0808  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 		 342 aa  84.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586145  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3485  hypothetical protein  50.65 
 
 		 87 aa  84.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.145421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.09 
 
 		 234 aa  84  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000966346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.09 
 
 		 234 aa  84  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.72 
 
 		 348 aa  84  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  48.72 
 
 		 348 aa  84  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.85 
 
 		 356 aa  84  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  44.58 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01475  hypothetical protein  50.63 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2010  transposase IS116/IS110/IS902  46.91 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.657114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2092  transposase IS116/IS110/IS902  46.91 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3124  transposase IS116/IS110/IS902  46.91 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3160  transposase IS116/IS110/IS902  46.91 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0233772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3275  transposase IS116/IS110/IS902  46.91 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3642  transposase IS116/IS110/IS902  46.91 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404408  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4440  transposase IS116/IS110/IS902  46.91 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05053  hypothetical protein  50.63 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>