More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3450 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3450  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  207  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.51037  normal  0.264897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1434  hypothetical protein  99.01 
 
 
101 aa  205  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  62.64 
 
 
342 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.44 
 
 
340 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0808  transposase IS116/IS110/IS902  57.43 
 
 
342 aa  128  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586145  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.44 
 
 
338 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5032  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  61.8 
 
 
338 aa  127  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3955  transposase IS116/IS110/IS902  56.44 
 
 
342 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0804  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  64.37 
 
 
181 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796908  hitchhiker  0.00222246 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  53.76 
 
 
343 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  53.76 
 
 
343 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  53.76 
 
 
343 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  53.76 
 
 
343 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  53.76 
 
 
343 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  53.76 
 
 
343 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  52.75 
 
 
341 aa  122  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  53.76 
 
 
343 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  52.69 
 
 
343 aa  123  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  53.93 
 
 
341 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  53.76 
 
 
343 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.84 
 
 
348 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  60.92 
 
 
342 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60.67 
 
 
340 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  60.92 
 
 
342 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  58.89 
 
 
341 aa  120  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3485  hypothetical protein  62.35 
 
 
87 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.145421 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  57.65 
 
 
298 aa  118  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.04 
 
 
499 aa  117  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.85 
 
 
341 aa  117  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.85 
 
 
341 aa  117  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1280  rmpB-like protein  56.99 
 
 
303 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0803  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.43 
 
 
340 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.95 
 
 
346 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.18 
 
 
346 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.68 
 
 
343 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.68 
 
 
343 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8011  transposase protein  60.42 
 
 
285 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0203844  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  50.51 
 
 
338 aa  114  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  50.51 
 
 
338 aa  114  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  50.51 
 
 
338 aa  114  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8798  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.69 
 
 
341 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.84 
 
 
338 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.84 
 
 
338 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  54.55 
 
 
348 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.55 
 
 
348 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  50.51 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  50.51 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  60 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  50.51 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.65 
 
 
344 aa  110  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 
350 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0965  transposase IS116/IS110/IS902  49.46 
 
 
346 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1574  transposase IS116/IS110/IS902  49.46 
 
 
346 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1966  transposase IS116/IS110/IS902  49.46 
 
 
346 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2010  transposase IS116/IS110/IS902  49.46 
 
 
346 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.657114  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2061  transposase IS116/IS110/IS902  49.46 
 
 
346 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.232183  normal  0.150463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2092  transposase IS116/IS110/IS902  49.46 
 
 
346 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3124  transposase IS116/IS110/IS902  49.46 
 
 
346 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3160  transposase IS116/IS110/IS902  49.46 
 
 
346 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0233772  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3275  transposase IS116/IS110/IS902  49.46 
 
 
346 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145129  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3642  transposase IS116/IS110/IS902  49.46 
 
 
346 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404408  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4440  transposase IS116/IS110/IS902  49.46 
 
 
346 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4622  transposase IS116/IS110/IS902  49.46 
 
 
346 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0504  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.55 
 
 
337 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0754  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.55 
 
 
337 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0914  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.55 
 
 
337 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.694774 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3024  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.55 
 
 
337 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.923031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  54.55 
 
 
343 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.45 
 
 
347 aa  106  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1017  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.22 
 
 
342 aa  106  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.22 
 
 
342 aa  106  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.22 
 
 
342 aa  106  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0894579  normal  0.267688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3844  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.22 
 
 
342 aa  106  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.464911  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.96 
 
 
350 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.96 
 
 
350 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.96 
 
 
350 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.96 
 
 
350 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  48.98 
 
 
338 aa  104  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3079  transposase IS116/IS110/IS902  48.98 
 
 
337 aa  103  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3085  transposase IS116/IS110/IS902  48.98 
 
 
337 aa  103  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.11 
 
 
338 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.45 
 
 
338 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  54.02 
 
 
341 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.65 
 
 
338 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.45 
 
 
338 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.45 
 
 
338 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.45 
 
 
338 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8455  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.76 
 
 
333 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.45 
 
 
338 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.45 
 
 
338 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.45 
 
 
338 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.45 
 
 
338 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  51.14 
 
 
337 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  51.14 
 
 
337 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4115  transposase  62.65 
 
 
86 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  52.87 
 
 
341 aa  100  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2519  transposase  55.17 
 
 
209 aa  100  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0829328  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 
338 aa  100  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 
338 aa  100  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 
338 aa  100  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>