More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0947 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0947  translation elongation factor Ts  100 
 
 
290 aa  586  1e-166  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.168966  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0515  elongation factor Ts  37.76 
 
 
288 aa  194  2e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0516  elongation factor Ts  37.15 
 
 
288 aa  191  1e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.203151  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  36.77 
 
 
307 aa  183  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  37.54 
 
 
300 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  34.04 
 
 
307 aa  175  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  35.17 
 
 
310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  36.9 
 
 
307 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  34.36 
 
 
307 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  34.28 
 
 
307 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  35.15 
 
 
308 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  36.55 
 
 
307 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  35.93 
 
 
308 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  33.91 
 
 
307 aa  169  6e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  35.25 
 
 
308 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  35.86 
 
 
306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  35.93 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  32.99 
 
 
308 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  35.14 
 
 
311 aa  166  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  35.86 
 
 
306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  35.86 
 
 
306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  32.99 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  32.19 
 
 
308 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  36.73 
 
 
308 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_002978  WD0531  elongation factor Ts  34.48 
 
 
286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  33.33 
 
 
288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  34.93 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  32.08 
 
 
312 aa  162  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  35.96 
 
 
309 aa  161  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  35.25 
 
 
288 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  33.69 
 
 
305 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  33.69 
 
 
305 aa  159  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  34.14 
 
 
307 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  36.64 
 
 
301 aa  159  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  35.62 
 
 
310 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  33.33 
 
 
310 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  36.57 
 
 
288 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  35.69 
 
 
279 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  33.9 
 
 
288 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  35.86 
 
 
303 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  35.37 
 
 
288 aa  157  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  35.86 
 
 
303 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  34.36 
 
 
303 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  33.1 
 
 
301 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  34.86 
 
 
303 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  36.75 
 
 
308 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  35.4 
 
 
308 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  34.95 
 
 
276 aa  153  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  35.71 
 
 
290 aa  152  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  34.69 
 
 
275 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  32.54 
 
 
288 aa  149  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  31.83 
 
 
278 aa  149  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  34.24 
 
 
286 aa  149  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  32.43 
 
 
312 aa  148  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  33.56 
 
 
288 aa  148  9e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  36.78 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  34.75 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  29.93 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4438  elongation factor Ts  34.83 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000816473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  31.74 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  35.56 
 
 
290 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  32.25 
 
 
278 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  36.21 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  33.33 
 
 
288 aa  145  8.000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  36.21 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  34.13 
 
 
289 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  32.09 
 
 
275 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  33.46 
 
 
276 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  32.41 
 
 
308 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  35.09 
 
 
270 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2734  translation elongation factor Ts  31.85 
 
 
284 aa  142  9e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450458  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  34.15 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  33.8 
 
 
292 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  31.88 
 
 
278 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  29.8 
 
 
313 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  33.45 
 
 
293 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  32.96 
 
 
291 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  36.47 
 
 
292 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  32.27 
 
 
293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  34.87 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0378  elongation factor Ts  30.07 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  32.76 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  32.76 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  32.76 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  32.76 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  32.76 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  32.18 
 
 
287 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  34.12 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  32.76 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  32.76 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  32.36 
 
 
269 aa  139  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  32.76 
 
 
293 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  33.21 
 
 
295 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  32.96 
 
 
295 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  33.21 
 
 
295 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  33.21 
 
 
295 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  33.21 
 
 
295 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  33.21 
 
 
295 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  32.99 
 
 
286 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  32.96 
 
 
295 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>