More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0305 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0305  putative transporter  100 
 
 
544 aa  1078    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1136  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  39.21 
 
 
532 aa  299  7e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0972  ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 
521 aa  282  8.000000000000001e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.200041  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.7 
 
 
539 aa  279  1e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.234714  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
553 aa  252  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
562 aa  250  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
562 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
554 aa  244  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
557 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
567 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.26 
 
 
560 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.26 
 
 
560 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
546 aa  229  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
562 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  30.7 
 
 
533 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
555 aa  229  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
559 aa  228  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
557 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
528 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
589 aa  223  6e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  31.7 
 
 
559 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  32.92 
 
 
557 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  31.87 
 
 
562 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
568 aa  219  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
574 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.75 
 
 
545 aa  216  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
565 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
562 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
562 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.46 
 
 
550 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
549 aa  210  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.82 
 
 
567 aa  210  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
558 aa  209  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1407  iron(III) ABC transporter permease protein  33.68 
 
 
543 aa  208  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.960253  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
569 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.78 
 
 
558 aa  204  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
558 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.27 
 
 
558 aa  203  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
544 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.553372  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
550 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
550 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
562 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
552 aa  200  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.778216  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  29.22 
 
 
541 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
540 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
566 aa  199  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  31.34 
 
 
553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  28.34 
 
 
541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
550 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
550 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0167  iron ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 
538 aa  197  6e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.471521  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
548 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62056  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0210  iron ABC transporter, permease protein  30.8 
 
 
538 aa  196  9e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.912172  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 
543 aa  196  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  30.88 
 
 
589 aa  196  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0188  iron ABC transporter, permease protein  30.62 
 
 
538 aa  196  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.26 
 
 
538 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  30.88 
 
 
589 aa  194  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
555 aa  193  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.665104  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.22 
 
 
555 aa  193  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.02 
 
 
548 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61199  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
540 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
582 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
540 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
541 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1525  ABC transporter, permease protein  30.88 
 
 
526 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  28.29 
 
 
555 aa  190  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
540 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
550 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.24 
 
 
506 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
565 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 
536 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.945562  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.48 
 
 
570 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  31.03 
 
 
543 aa  187  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1377  iron ABC transporter permease  31.76 
 
 
570 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300501  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
556 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
550 aa  186  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1778  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  31.45 
 
 
568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370129  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 
538 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
558 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.98 
 
 
538 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  31.52 
 
 
538 aa  183  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1510  ABC transporter, permease protein  31.67 
 
 
570 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0689  iron ABC transporter permease  31.67 
 
 
570 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000577033  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1381  iron ABC transporter permease  31.67 
 
 
570 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1181  iron ABC transporter permease  31.67 
 
 
570 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0463  iron ABC transporter permease  31.67 
 
 
570 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  27.52 
 
 
541 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.09 
 
 
542 aa  181  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  30.06 
 
 
529 aa  179  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.75 
 
 
543 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
525 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0116  iron ABC transporter, permease protein  29.75 
 
 
518 aa  174  3.9999999999999995e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2857  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  32.1 
 
 
548 aa  174  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
553 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.725072  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1013  iron(III) ABC transporter, permease protein  28.75 
 
 
542 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0312612  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05531  putative iron ABC transporter  26.15 
 
 
512 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.103607  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05461  putative iron ABC transporter  26.09 
 
 
528 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.613032  normal  0.31003 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1086  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  31.48 
 
 
537 aa  170  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0627079  normal  0.556717 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.34 
 
 
544 aa  170  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>