More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1942 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 255 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85.6 
 
 		 257 aa  345  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.51 
 
 		 255 aa  292  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.841301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.05 
 
 		 255 aa  288  7e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.836425  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.25 
 
 		 275 aa  284  8e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0247795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.89 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0928322 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.52 
 
 		 267 aa  185  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.44 
 
 		 261 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0372396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0286  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3237  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.73 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.85457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3273  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.73 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2291  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.73 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448302  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3288  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.73 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.73 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2168  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.73 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408948  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0537  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.73 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3014  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  43.46 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.698047  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.88 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0780  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.67 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0427  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.03 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450899  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.81 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1339  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.67 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.789963  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.36 
 
 		 271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.08 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218017  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 		 277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 		 249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2676  short chain dehydrogenase  36.93 
 
 		 264 aa  111  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.649512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300792  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 280 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  35.12 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 		 277 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.313918 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.88847  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1490  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 239 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0112  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.73 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0729  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503076  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0099  short chain dehydrogenase  35.39 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.92 
 
 		 244 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0130  short chain dehydrogenase  32.1 
 
 		 265 aa  99.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727225  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0813  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.13 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 		 266 aa  98.6  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 251 aa  98.6  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 		 259 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.187579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  31.1 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.33 
 
 		 238 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371699  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.461582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  31.1 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  28.63 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.5 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 		 275 aa  96.3  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3806  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 		 260 aa  95.9  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0085  gluconate 5-dehydrogenase  32.58 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2951  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 		 276 aa  95.5  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 		 321 aa  95.5  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 275 aa  95.1  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  34.07 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.9 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 		 240 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.04 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>