More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0780 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0780  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 251 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 236 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450899  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.29 
 
 		 261 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1339  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  74.67 
 
 		 261 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.789963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  67.87 
 
 		 262 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3273  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  67.87 
 
 		 262 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2291  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  67.87 
 
 		 262 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448302  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3288  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  67.87 
 
 		 262 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0537  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  67.87 
 
 		 262 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2168  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  67.87 
 
 		 262 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3237  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  67.07 
 
 		 262 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.85457  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.95 
 
 		 261 aa  331  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0372396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.67 
 
 		 263 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3014  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  41.22 
 
 		 257 aa  195  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.698047  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0286  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.57 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.841301 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0427  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.41 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0247795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.5 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.836425  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.41 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0928322 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 279 aa  125  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.649512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.33 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0729  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 259 aa  118  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0130  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0085  gluconate 5-dehydrogenase  35 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2676  short chain dehydrogenase  30.95 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0099  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 		 277 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.313918 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218017  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  32 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.461582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0471693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3307  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0864591  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2904  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000166666  decreased coverage  0.000436169 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3806  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6265  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2785  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.187579 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0382  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.314117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.88847  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4895  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000739396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 		 266 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 		 270 aa  92.4  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2834  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.499263 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  30.28 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2971  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0185  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00978147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01815  short chain dehydrogenase  32.48 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  36.13 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.28 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371699  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 		 274 aa  89  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.980517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0813  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.19 
 
 		 253 aa  89  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  31.01 
 
 		 270 aa  88.6  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 		 242 aa  88.6  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.88898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 241 aa  88.6  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0151  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2937  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2922  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  32.74 
 
 		 237 aa  87.8  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>