22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1064 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1064  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  214  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1325  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 		 370 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  39.6 
 
 		 510 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1278  secretion protein HlyD  34.62 
 
 		 370 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0363804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1570  RND family efflux transporter MFP subunit  39.58 
 
 		 375 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.628485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3112  RND family efflux transporter MFP subunit  35.42 
 
 		 374 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2342  secretion protein HlyD  37.63 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1148  RND family efflux transporter MFP subunit  35.05 
 
 		 373 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2635  RND family efflux transporter MFP subunit  34.38 
 
 		 370 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0171634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.04 
 
 		 379 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1390  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.56 
 
 		 368 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2987  RND family efflux transporter MFP subunit  36.56 
 
 		 368 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.331807  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1312  RND family efflux transporter MFP subunit  31.18 
 
 		 371 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1593  RND family efflux transporter MFP subunit  37.5 
 
 		 631 aa  68.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351482  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2973  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.388324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3131  RND family efflux transporter MFP subunit  36.26 
 
 		 368 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.419387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1246  RND family efflux transporter MFP subunit  34.02 
 
 		 373 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1296  RND family efflux transporter MFP subunit  34.02 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00794293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1316  RND family efflux transporter MFP subunit  34.02 
 
 		 373 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0457326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3278  hypothetical protein  31.96 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0251  efflux transporter  35.16 
 
 		 383 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1310  secretion protein HlyD  31 
 
 		 379 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.673983  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>