85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1141 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1141  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  682    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0263  Sel1 domain-containing protein  70.33 
 
 
288 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.998583  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1139  hypothetical protein  69 
 
 
336 aa  411  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.882872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0265  Sel1 domain-containing protein  64.01 
 
 
353 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2625  hypothetical protein  33.65 
 
 
325 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.614484  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2628  hypothetical protein  30.15 
 
 
328 aa  119  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2627  hypothetical protein  28.7 
 
 
333 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2626  hypothetical protein  27.2 
 
 
250 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.16 
 
 
599 aa  73.2  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  27.62 
 
 
376 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  26.6 
 
 
376 aa  62.8  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  33.74 
 
 
482 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.25 
 
 
416 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  28.97 
 
 
831 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  27.01 
 
 
267 aa  56.2  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0434  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
464 aa  56.2  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  27.65 
 
 
256 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  28.27 
 
 
1402 aa  55.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.95 
 
 
360 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  29.87 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  31.86 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.98 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
976 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  30.22 
 
 
684 aa  52.8  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.71 
 
 
490 aa  52.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
1032 aa  52.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  27.34 
 
 
337 aa  52.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  27.41 
 
 
489 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  31.43 
 
 
685 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  29.52 
 
 
329 aa  52  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  33.14 
 
 
490 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  32.77 
 
 
208 aa  52  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  29.63 
 
 
246 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  30.05 
 
 
245 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  28.07 
 
 
328 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  25.69 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3674  enhanced entry protein  28.33 
 
 
540 aa  50.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  28.31 
 
 
552 aa  49.7  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  27.78 
 
 
393 aa  49.3  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  41.1 
 
 
839 aa  49.3  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0338  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.35 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1290  hypothetical protein  26 
 
 
1602 aa  49.3  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.450967 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0344  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.64 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.4 
 
 
261 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  26.05 
 
 
961 aa  48.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  27.09 
 
 
235 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  32.54 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.16 
 
 
2413 aa  47.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  29.73 
 
 
557 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  28.71 
 
 
1877 aa  47.8  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  23.79 
 
 
509 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  25 
 
 
509 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.43 
 
 
360 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
303 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  27.19 
 
 
680 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  29.94 
 
 
464 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  34.45 
 
 
255 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  27.7 
 
 
940 aa  45.8  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0145  Sel1 repeat-containing protein  34.74 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  31.38 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  28.97 
 
 
357 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.07 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.5 
 
 
528 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0373  hypothetical protein  30 
 
 
193 aa  44.3  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.784905  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.96 
 
 
346 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.88 
 
 
380 aa  44.3  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3565  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.22 
 
 
418 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  24.35 
 
 
1493 aa  44.3  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2699  Sel1 domain-containing protein repeat-containing protein  29.77 
 
 
202 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0148338  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2666  Sel1 domain-containing protein  27.57 
 
 
381 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0163222  normal  0.379262 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  32.12 
 
 
221 aa  43.9  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  28 
 
 
366 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  26.59 
 
 
789 aa  43.5  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  27.27 
 
 
342 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.87 
 
 
512 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.21 
 
 
392 aa  43.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0412  Sel1  29.38 
 
 
193 aa  43.1  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  32.35 
 
 
274 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0340  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 
298 aa  42.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0465  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
255 aa  43.1  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.41 
 
 
363 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  28.17 
 
 
232 aa  42.7  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.5 
 
 
341 aa  42.7  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1217  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.39 
 
 
281 aa  42.4  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>