26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2625 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2625  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  673    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2628  hypothetical protein  45.6 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2627  hypothetical protein  42.99 
 
 		 333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2626  hypothetical protein  42.8 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0265  Sel1 domain-containing protein  32.3 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1139  hypothetical protein  30.75 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0263  Sel1 domain-containing protein  30.16 
 
 		 288 aa  94.4  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.998583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.45 
 
 		 1012 aa  56.2  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.25 
 
 		 1196 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  30.25 
 
 		 1081 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  28.31 
 
 		 416 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  29.96 
 
 		 831 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  24.25 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.78 
 
 		 1261 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  28.5 
 
 		 350 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.15 
 
 		 565 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2590  Sel1 domain-containing protein  25.31 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  26.02 
 
 		 489 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  25.93 
 
 		 978 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  27.43 
 
 		 684 aa  43.9  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1402 aa  43.9  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  24.86 
 
 		 1242 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  27.8 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  25.53 
 
 		 256 aa  42.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  22.55 
 
 		 599 aa  42.4  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>