22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2628 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2628  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  675    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2627  hypothetical protein  55.96 
 
 		 333 aa  363  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2625  hypothetical protein  45.6 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2626  hypothetical protein  50.2 
 
 		 250 aa  255  9e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1141  hypothetical protein  30.15 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1139  hypothetical protein  30.12 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0265  Sel1 domain-containing protein  29.02 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0263  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.998583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 		 1430 aa  50.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  25.11 
 
 		 599 aa  49.7  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3360  serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 		 656 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.22 
 
 		 1012 aa  46.6  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0033  hypothetical protein  25.86 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737602  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0505  hypothetical protein  29.59 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  28.4 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0800  Sel1 repeat-containing protein  26.35 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  28.47 
 
 		 399 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  31.69 
 
 		 684 aa  44.3  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.93 
 
 		 363 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  25.37 
 
 		 482 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0338  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.36 
 
 		 278 aa  42.4  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>