18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2626 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2626  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  517  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2628  hypothetical protein  50.2 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2625  hypothetical protein  42.8 
 
 		 325 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2627  hypothetical protein  43.2 
 
 		 333 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0265  Sel1 domain-containing protein  27.38 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1141  hypothetical protein  27.2 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1139  hypothetical protein  27.07 
 
 		 336 aa  72  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882872 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  29.89 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0263  Sel1 domain-containing protein  25.84 
 
 		 288 aa  53.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.998583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1281 aa  48.9  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  30.67 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  27.31 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.64 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2792  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.29 
 
 		 455 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  25.39 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  27.18 
 
 		 684 aa  42  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  29.7 
 
 		 1081 aa  42  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  27.98 
 
 		 789 aa  42  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>