More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1280 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1280  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
458 aa  932    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.320775 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.03 
 
 
414 aa  322  8e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1893  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.16 
 
 
424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.185054 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0529  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.89 
 
 
419 aa  298  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3009  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.91 
 
 
472 aa  271  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.75 
 
 
448 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.54 
 
 
453 aa  226  9e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.53 
 
 
455 aa  219  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.29 
 
 
402 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.39 
 
 
405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.6 
 
 
392 aa  217  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.67 
 
 
463 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.51 
 
 
469 aa  216  7e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.11 
 
 
458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.06 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6807  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.26 
 
 
501 aa  212  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0976698  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.29 
 
 
456 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4330  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.64 
 
 
548 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554584  normal  0.651535 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.08 
 
 
475 aa  211  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.65 
 
 
407 aa  210  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2078  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.83 
 
 
402 aa  210  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3211  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.68 
 
 
450 aa  209  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173866  normal  0.203327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6605  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.26 
 
 
531 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1582  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.66 
 
 
445 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117148  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.11 
 
 
445 aa  208  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0612657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1615  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.66 
 
 
445 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000193789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.81 
 
 
452 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.86 
 
 
401 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.33 
 
 
451 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1719  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.63 
 
 
454 aa  208  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.623668  hitchhiker  0.0000296907 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1309  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.52 
 
 
398 aa  208  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.92 
 
 
492 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0340  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.33 
 
 
402 aa  207  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.194852 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.27 
 
 
423 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0281  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.55 
 
 
417 aa  207  3e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.396563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.63 
 
 
452 aa  207  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6068  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.33 
 
 
507 aa  207  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0339601  normal  0.285374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.63 
 
 
452 aa  207  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.18 
 
 
393 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.63 
 
 
452 aa  207  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.63 
 
 
452 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.63 
 
 
452 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.85 
 
 
463 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.63 
 
 
452 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.63 
 
 
452 aa  207  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  33.88 
 
 
405 aa  206  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.63 
 
 
452 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1695  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.01 
 
 
536 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85082 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.63 
 
 
452 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.79 
 
 
459 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.81 
 
 
388 aa  206  7e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.11 
 
 
406 aa  206  9e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.9 
 
 
398 aa  206  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.97 
 
 
476 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.8 
 
 
475 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0620  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.36 
 
 
477 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419722  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.7 
 
 
463 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2037  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.8 
 
 
465 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.89 
 
 
463 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.75 
 
 
459 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.66 
 
 
414 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.57 
 
 
463 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.29 
 
 
414 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.25 
 
 
411 aa  205  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2996  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.43 
 
 
527 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.05 
 
 
396 aa  203  4e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3498  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.53 
 
 
526 aa  203  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4284  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.38 
 
 
527 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671183  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.43 
 
 
443 aa  202  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.58 
 
 
398 aa  202  8e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.6 
 
 
458 aa  202  8e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.06 
 
 
446 aa  202  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.65 
 
 
400 aa  202  9e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1352  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.39 
 
 
537 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.43 
 
 
446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.54 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.65 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0056  putative exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.9 
 
 
388 aa  201  3e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0712  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.14 
 
 
511 aa  200  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4621  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.03 
 
 
541 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.86 
 
 
445 aa  199  6e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.83026  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4549  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.73 
 
 
526 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1865  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.96 
 
 
411 aa  199  7.999999999999999e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.862893 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.56 
 
 
449 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0171  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.04 
 
 
453 aa  199  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2064  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.98 
 
 
403 aa  199  9e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0764  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.14 
 
 
511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2553  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.16 
 
 
541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.30129  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.78 
 
 
449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.65 
 
 
443 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3174  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.55 
 
 
541 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.515348  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.78 
 
 
449 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.32 
 
 
447 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.78 
 
 
449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1093  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.89 
 
 
474 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18484  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1859  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.21 
 
 
538 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.020819 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.73 
 
 
519 aa  197  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.56 
 
 
536 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.56 
 
 
449 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.08 
 
 
456 aa  196  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>