More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2849 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  100 
 
 
369 aa  759    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  68.98 
 
 
370 aa  513  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  63.46 
 
 
371 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  63.29 
 
 
369 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  53.83 
 
 
411 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  53.95 
 
 
411 aa  397  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  53.95 
 
 
411 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  50.41 
 
 
390 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  50 
 
 
408 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  51.12 
 
 
386 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  50.41 
 
 
407 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  50.97 
 
 
394 aa  363  3e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  48.88 
 
 
388 aa  362  4e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  48.77 
 
 
393 aa  358  6e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  45.75 
 
 
384 aa  353  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  49.72 
 
 
388 aa  342  7e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  47.21 
 
 
407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  46.09 
 
 
387 aa  332  6e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  47.51 
 
 
407 aa  332  9e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  44.99 
 
 
403 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  42.54 
 
 
368 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  43.89 
 
 
408 aa  300  4e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  42.19 
 
 
416 aa  296  5e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  44.72 
 
 
408 aa  295  6e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  44.2 
 
 
396 aa  293  4e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  42.78 
 
 
406 aa  287  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  41.67 
 
 
408 aa  281  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  37.3 
 
 
411 aa  272  7e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  38.18 
 
 
406 aa  211  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  33.62 
 
 
397 aa  199  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  33.63 
 
 
398 aa  192  9e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  34.19 
 
 
398 aa  189  8e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  32.85 
 
 
471 aa  159  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  32.54 
 
 
463 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  32.56 
 
 
467 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  32.94 
 
 
464 aa  150  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  32.65 
 
 
464 aa  149  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  30.73 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  31.86 
 
 
470 aa  143  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  29.49 
 
 
469 aa  139  8.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  30.7 
 
 
488 aa  137  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  29.91 
 
 
471 aa  136  5e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  30.77 
 
 
470 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  30.4 
 
 
469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  34.46 
 
 
465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  34.46 
 
 
465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  34.08 
 
 
465 aa  129  8.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  30.57 
 
 
471 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  31.09 
 
 
465 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  32.96 
 
 
465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  32.96 
 
 
465 aa  126  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  32.96 
 
 
463 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  32.96 
 
 
465 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  32.96 
 
 
465 aa  126  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  32.96 
 
 
465 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  32.96 
 
 
465 aa  126  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  32.96 
 
 
465 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  32.96 
 
 
465 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  32.96 
 
 
465 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  32.96 
 
 
465 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  31.38 
 
 
465 aa  126  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  27.22 
 
 
475 aa  126  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  28.86 
 
 
467 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.19 
 
 
469 aa  123  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  28.03 
 
 
474 aa  122  8e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  28.21 
 
 
475 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  32.21 
 
 
465 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  28.48 
 
 
483 aa  120  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  31.32 
 
 
476 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.03 
 
 
490 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  30.03 
 
 
487 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  29.52 
 
 
487 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  29.21 
 
 
472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  28.43 
 
 
470 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  26.99 
 
 
476 aa  116  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  28.91 
 
 
472 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  30.08 
 
 
476 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  28.62 
 
 
479 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  29.71 
 
 
470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  28.66 
 
 
472 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.55 
 
 
472 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  27.88 
 
 
480 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  28.62 
 
 
552 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  27.11 
 
 
466 aa  113  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  28.9 
 
 
499 aa  113  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  29.12 
 
 
471 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.3 
 
 
470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  29.32 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  29.84 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.12 
 
 
482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  27.48 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  30.22 
 
 
485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  30.19 
 
 
473 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  27.73 
 
 
468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  29.36 
 
 
471 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  26.98 
 
 
479 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  27.39 
 
 
479 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1078  FeS assembly protein SufB  27.09 
 
 
471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000122877  normal  0.697067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  27.71 
 
 
470 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  31.1 
 
 
470 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>