More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0489 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  81.82 
 
 
396 aa  694    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  81.13 
 
 
408 aa  711    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  81.62 
 
 
408 aa  716    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  100 
 
 
408 aa  837    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  68.89 
 
 
406 aa  610  1e-173  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  47.46 
 
 
407 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  46.95 
 
 
407 aa  373  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  48.05 
 
 
411 aa  362  4e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  45.07 
 
 
416 aa  362  9e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  47.81 
 
 
411 aa  360  2e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  47.79 
 
 
390 aa  358  7e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  46.79 
 
 
411 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  43.83 
 
 
407 aa  356  5e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  43.61 
 
 
403 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  43.24 
 
 
408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  47.59 
 
 
393 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  43.54 
 
 
388 aa  338  8e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  44.56 
 
 
386 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  45.3 
 
 
411 aa  335  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  41.16 
 
 
384 aa  317  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  45.22 
 
 
394 aa  317  4e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  45 
 
 
371 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  44.17 
 
 
370 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  40.63 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  44.97 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  41.26 
 
 
369 aa  301  2e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  41.67 
 
 
369 aa  281  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  38.42 
 
 
368 aa  276  7e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  32.69 
 
 
406 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  34.62 
 
 
397 aa  244  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  35.21 
 
 
398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  32.93 
 
 
398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  32.34 
 
 
469 aa  196  7e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  31.34 
 
 
463 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  28.61 
 
 
470 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  31.12 
 
 
465 aa  176  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  30.1 
 
 
476 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  30.2 
 
 
464 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  30.45 
 
 
464 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  29.6 
 
 
476 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  30.6 
 
 
465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  30.6 
 
 
465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  30.92 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  30.6 
 
 
465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  30.6 
 
 
465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  30.6 
 
 
465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  30.68 
 
 
463 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  30.36 
 
 
465 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  29.55 
 
 
488 aa  173  5e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  30.36 
 
 
465 aa  173  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  29.46 
 
 
471 aa  173  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  30.36 
 
 
465 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  30.36 
 
 
465 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  31.42 
 
 
470 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.17 
 
 
470 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  32.38 
 
 
441 aa  171  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  30.17 
 
 
465 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  30.17 
 
 
465 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  28.6 
 
 
480 aa  170  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  28.77 
 
 
485 aa  170  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  29.47 
 
 
469 aa  169  6e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.27 
 
 
470 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  28.19 
 
 
469 aa  169  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  29.53 
 
 
485 aa  169  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  29 
 
 
479 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.85 
 
 
482 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  29.62 
 
 
472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  29.64 
 
 
465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  30.02 
 
 
487 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  27.57 
 
 
470 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  27.93 
 
 
471 aa  167  4e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  27.68 
 
 
467 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  29.38 
 
 
481 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  29.53 
 
 
470 aa  166  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  28.93 
 
 
472 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  28.86 
 
 
479 aa  166  8e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  29.03 
 
 
470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  29.26 
 
 
472 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  27.97 
 
 
481 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  29.93 
 
 
470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  28.53 
 
 
472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  30.22 
 
 
466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  29.1 
 
 
478 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  28.78 
 
 
479 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  28.21 
 
 
468 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  28.84 
 
 
467 aa  164  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  27.58 
 
 
470 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  30.2 
 
 
465 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  28.78 
 
 
479 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  30.28 
 
 
483 aa  162  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0931  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  28.57 
 
 
507 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122156  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  28.29 
 
 
487 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  25.29 
 
 
472 aa  162  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2255  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  28.57 
 
 
507 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  28.29 
 
 
487 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  28.29 
 
 
487 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  28.29 
 
 
487 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0925  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  28.57 
 
 
507 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  30.32 
 
 
465 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  27.61 
 
 
481 aa  160  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>