More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1001 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  100 
 
 		 390 aa  800    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  71.96 
 
 		 393 aa  567  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  66.14 
 
 		 388 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  61.2 
 
 		 386 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  64.94 
 
 		 388 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  57.29 
 
 		 387 aa  471  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  49.87 
 
 		 384 aa  433  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  55.34 
 
 		 408 aa  428  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  55.92 
 
 		 411 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  55.4 
 
 		 411 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  52.86 
 
 		 411 aa  413  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  52.27 
 
 		 407 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  53.09 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  49.61 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  53.22 
 
 		 369 aa  390  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  50.14 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  51.37 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  49.73 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  50.41 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  47.79 
 
 		 408 aa  358  6e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  46.75 
 
 		 408 aa  358  7e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  47.53 
 
 		 408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  47.27 
 
 		 396 aa  355  1e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  45.21 
 
 		 403 aa  349  6e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  46.98 
 
 		 406 aa  345  7e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  47.41 
 
 		 411 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  43.44 
 
 		 416 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  46.05 
 
 		 368 aa  321  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  35.92 
 
 		 406 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  34.22 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  34.21 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  35.63 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  31.04 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  33.02 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  31.13 
 
 		 441 aa  160  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  30.45 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  31.08 
 
 		 471 aa  155  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  31.8 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  31.82 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  32.52 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  32.31 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  32 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  32.11 
 
 		 472 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  32.1 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 		 474 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  29.63 
 
 		 475 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  31.75 
 
 		 465 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  29.14 
 
 		 466 aa  147  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  29.95 
 
 		 481 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  31.64 
 
 		 471 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  31.76 
 
 		 488 aa  145  9e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  30.56 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  27.94 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  29.63 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  29.48 
 
 		 481 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  32.21 
 
 		 490 aa  143  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  30.16 
 
 		 487 aa  143  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  31.04 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  31.34 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  29.7 
 
 		 479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  30.91 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  32.02 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  30.82 
 
 		 487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  30.24 
 
 		 468 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  30.3 
 
 		 470 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  29.84 
 
 		 465 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  29.84 
 
 		 465 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  29.14 
 
 		 479 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  29.84 
 
 		 465 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  29.84 
 
 		 465 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  29.84 
 
 		 465 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  29.84 
 
 		 463 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  29.84 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  29.84 
 
 		 465 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  29.84 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  29.5 
 
 		 475 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  30.48 
 
 		 465 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  29.28 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  29.84 
 
 		 465 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  29.73 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  29.36 
 
 		 476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  30.16 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1078  FeS assembly protein SufB  29.57 
 
 		 471 aa  137  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000122877  normal  0.697067 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  28.87 
 
 		 476 aa  136  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  28.73 
 
 		 485 aa  135  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.97 
 
 		 470 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  31.03 
 
 		 465 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  31.03 
 
 		 465 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  28.75 
 
 		 476 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.45 
 
 		 483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  30.21 
 
 		 469 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.33 
 
 		 470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  30.54 
 
 		 466 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  26.85 
 
 		 470 aa  133  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  28.45 
 
 		 487 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  28.18 
 
 		 472 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  28.45 
 
 		 487 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  27.9 
 
 		 480 aa  133  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  28.45 
 
 		 487 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  30.4 
 
 		 470 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>