More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1923 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  100 
 
 		 387 aa  800    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  68.99 
 
 		 386 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  68.99 
 
 		 388 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  69.53 
 
 		 388 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  62.11 
 
 		 393 aa  511  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  57.29 
 
 		 390 aa  471  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  52.34 
 
 		 384 aa  430  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  50.42 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  49.07 
 
 		 411 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  48.54 
 
 		 411 aa  374  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  48.28 
 
 		 411 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  50.28 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  49.05 
 
 		 369 aa  363  4e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  46.21 
 
 		 407 aa  352  8e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  45.21 
 
 		 407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  45.18 
 
 		 371 aa  339  5e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  45.33 
 
 		 370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  44.95 
 
 		 407 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  46.09 
 
 		 369 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  43.41 
 
 		 403 aa  329  4e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  41.41 
 
 		 416 aa  319  6e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  44.2 
 
 		 368 aa  312  5.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  42.66 
 
 		 411 aa  309  5e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  40.63 
 
 		 408 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  40 
 
 		 406 aa  300  3e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  39.84 
 
 		 408 aa  300  4e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  40.11 
 
 		 396 aa  298  2e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  39.31 
 
 		 408 aa  293  5e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  35.52 
 
 		 397 aa  213  7e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  37.03 
 
 		 406 aa  212  9e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  38.44 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  35.78 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  28.53 
 
 		 467 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  29.7 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  31.32 
 
 		 471 aa  163  6e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  32.09 
 
 		 468 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  30.49 
 
 		 441 aa  156  7e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  27.22 
 
 		 471 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  26.34 
 
 		 474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  32.2 
 
 		 472 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  29.04 
 
 		 464 aa  152  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  28.53 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  28.49 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  29.69 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  27.97 
 
 		 472 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  28.49 
 
 		 464 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  31.58 
 
 		 465 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  28.16 
 
 		 472 aa  147  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  28.15 
 
 		 470 aa  145  9e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.18 
 
 		 470 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  28.93 
 
 		 471 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  29.32 
 
 		 471 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  31.11 
 
 		 488 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  29.03 
 
 		 487 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  28.5 
 
 		 471 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  29.11 
 
 		 467 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  28.81 
 
 		 485 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  30.03 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  29.28 
 
 		 465 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  30.34 
 
 		 465 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  30.34 
 
 		 465 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  29.28 
 
 		 465 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  30.34 
 
 		 465 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  30.34 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  26.74 
 
 		 469 aa  143  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  30.34 
 
 		 465 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  30.65 
 
 		 465 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  28.73 
 
 		 476 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  28.69 
 
 		 485 aa  143  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  30.34 
 
 		 465 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  28.73 
 
 		 481 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  30.34 
 
 		 465 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.69 
 
 		 490 aa  143  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  30.34 
 
 		 465 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  28.74 
 
 		 483 aa  142  8e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  30.34 
 
 		 465 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  28.37 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  27.98 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  29.19 
 
 		 469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  29.92 
 
 		 479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.34 
 
 		 482 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  29.92 
 
 		 479 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  29.38 
 
 		 487 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  29.38 
 
 		 487 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  29.38 
 
 		 487 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  28.45 
 
 		 476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  26.87 
 
 		 476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  26.34 
 
 		 476 aa  140  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  28.43 
 
 		 466 aa  139  7e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  26.02 
 
 		 472 aa  139  7e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  27.9 
 
 		 481 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  27.62 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  28.3 
 
 		 487 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  27.9 
 
 		 472 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  29.97 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  27.62 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  27.15 
 
 		 476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  27.45 
 
 		 473 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  28.61 
 
 		 477 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  28.49 
 
 		 471 aa  136  7.000000000000001e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>