More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1201 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  100 
 
 		 384 aa  794    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  53.16 
 
 		 388 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  51.98 
 
 		 386 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  53.66 
 
 		 393 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  49.87 
 
 		 390 aa  433  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  52.34 
 
 		 387 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  54.67 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  46.35 
 
 		 408 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  47.51 
 
 		 407 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  48.75 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  48.41 
 
 		 394 aa  355  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  45.75 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  46.26 
 
 		 369 aa  354  2e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  44.33 
 
 		 407 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  46.26 
 
 		 411 aa  348  6e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  45.72 
 
 		 411 aa  347  2e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  47.92 
 
 		 411 aa  341  1e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  42.93 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  44.54 
 
 		 370 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  41.55 
 
 		 403 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  41.16 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  42.74 
 
 		 408 aa  316  4e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  42.22 
 
 		 408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  42.48 
 
 		 396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  42.89 
 
 		 416 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  39.74 
 
 		 411 aa  298  9e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  43.02 
 
 		 368 aa  296  5e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  40.66 
 
 		 406 aa  294  2e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  34.32 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  36.79 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  34.12 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  33.88 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  31.35 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  33.22 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  33.22 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  33.22 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  33.22 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  33.22 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  33.22 
 
 		 465 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  32.89 
 
 		 465 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  33.22 
 
 		 465 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  32.89 
 
 		 465 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  33.22 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  33.22 
 
 		 465 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  33.01 
 
 		 465 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  31.27 
 
 		 471 aa  152  7e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  31.12 
 
 		 472 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  32.37 
 
 		 465 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  31.56 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  30.39 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  31.87 
 
 		 476 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  31.56 
 
 		 476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  30.82 
 
 		 472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  31.78 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  30.75 
 
 		 480 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  31.25 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  30.94 
 
 		 481 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  30.22 
 
 		 472 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  28.81 
 
 		 467 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  31 
 
 		 469 aa  142  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  30.82 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  29.28 
 
 		 475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  31.39 
 
 		 469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  28.83 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.51 
 
 		 469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  28.97 
 
 		 476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.41 
 
 		 490 aa  140  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  29.69 
 
 		 485 aa  139  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  28.93 
 
 		 463 aa  139  7e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  29.63 
 
 		 487 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  30.31 
 
 		 472 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  30.99 
 
 		 464 aa  139  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  30 
 
 		 470 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  29.69 
 
 		 487 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  29.5 
 
 		 485 aa  139  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  30.31 
 
 		 470 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  29.69 
 
 		 487 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  29.69 
 
 		 487 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  30.63 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  29.21 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.31 
 
 		 482 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  29.69 
 
 		 479 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  30.31 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  30 
 
 		 487 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  29.69 
 
 		 479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  30.84 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  29.97 
 
 		 466 aa  137  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  31.29 
 
 		 476 aa  137  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  30.16 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  31.37 
 
 		 477 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  30.16 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  30.03 
 
 		 471 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  29.38 
 
 		 470 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.39 
 
 		 472 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  29.45 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  26.88 
 
 		 476 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  29.06 
 
 		 485 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  29.69 
 
 		 481 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  29.91 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>