More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2451 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  100 
 
 		 407 aa  834    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  55.67 
 
 		 411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  55.91 
 
 		 411 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  55.42 
 
 		 411 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  53.48 
 
 		 403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  53.63 
 
 		 408 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  49.11 
 
 		 407 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  57.51 
 
 		 394 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  52.27 
 
 		 390 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  49.36 
 
 		 407 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  47.46 
 
 		 408 aa  396  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  50.26 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  48.04 
 
 		 408 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  48.8 
 
 		 386 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  50.13 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  47.21 
 
 		 408 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  48.39 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  50.27 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  48.17 
 
 		 396 aa  385  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  51.12 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  44.42 
 
 		 416 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  50.14 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  44.94 
 
 		 411 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  47.51 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  50.27 
 
 		 388 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  50.41 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  46.21 
 
 		 387 aa  352  8e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  46.76 
 
 		 368 aa  338  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  38.92 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  39.12 
 
 		 397 aa  253  3e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  37.28 
 
 		 398 aa  239  5.999999999999999e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  37.73 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  32.2 
 
 		 441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  32.8 
 
 		 467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  30.75 
 
 		 471 aa  173  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  30.79 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  31.27 
 
 		 464 aa  162  9e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  31 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  30.99 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  29.43 
 
 		 476 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  30.29 
 
 		 465 aa  159  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  30.16 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.95 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  29.08 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  29.86 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  29.32 
 
 		 465 aa  157  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  29.52 
 
 		 475 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  28.89 
 
 		 476 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.44 
 
 		 490 aa  155  8e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  29.71 
 
 		 471 aa  156  8e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  29.63 
 
 		 470 aa  155  9e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  29.82 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  29.32 
 
 		 465 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  29.32 
 
 		 465 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  29.07 
 
 		 463 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  29.97 
 
 		 470 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  28.4 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  29.07 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  29.07 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  29.07 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  29.07 
 
 		 465 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  29.07 
 
 		 465 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  29.07 
 
 		 465 aa  153  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  29.07 
 
 		 465 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  28.82 
 
 		 465 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  28.82 
 
 		 465 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  29.92 
 
 		 476 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  29.82 
 
 		 465 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.64 
 
 		 482 aa  152  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  27.65 
 
 		 487 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  30.1 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.72 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.19 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  28.43 
 
 		 487 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  28.43 
 
 		 487 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  29.58 
 
 		 466 aa  151  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  28.43 
 
 		 487 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  28.32 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  28.15 
 
 		 485 aa  150  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  28.18 
 
 		 470 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  28.43 
 
 		 485 aa  150  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  28.89 
 
 		 471 aa  150  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  27.23 
 
 		 480 aa  150  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  30 
 
 		 475 aa  149  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  27.9 
 
 		 470 aa  149  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.89 
 
 		 475 aa  149  9e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  29.86 
 
 		 488 aa  149  9e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  29.11 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.06 
 
 		 470 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  27.7 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  27.41 
 
 		 479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  28.15 
 
 		 472 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  27.41 
 
 		 481 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  27.94 
 
 		 479 aa  146  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.43 
 
 		 469 aa  146  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  27.82 
 
 		 476 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  27.3 
 
 		 470 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  28.4 
 
 		 478 aa  145  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  30.11 
 
 		 483 aa  145  9e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>