More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0417 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  100 
 
 		 408 aa  838    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  94.85 
 
 		 408 aa  804    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  95.2 
 
 		 396 aa  781    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  81.13 
 
 		 408 aa  711    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  66.91 
 
 		 406 aa  580  1e-164  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  48.04 
 
 		 407 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  47.95 
 
 		 407 aa  376  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  44.74 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  45.97 
 
 		 407 aa  361  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  46.75 
 
 		 390 aa  358  7e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  43.59 
 
 		 408 aa  344  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  43.88 
 
 		 403 aa  343  4e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  44.06 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  44.65 
 
 		 411 aa  334  1e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  44.19 
 
 		 393 aa  332  9e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  43.93 
 
 		 411 aa  332  1e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  44.19 
 
 		 411 aa  331  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  42.22 
 
 		 388 aa  326  5e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  46.01 
 
 		 370 aa  325  1e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  42.97 
 
 		 386 aa  319  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  43.99 
 
 		 369 aa  316  4e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  42.22 
 
 		 384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  44.88 
 
 		 394 aa  312  5.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  44.57 
 
 		 371 aa  312  7.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  43.24 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  39.84 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  43.89 
 
 		 369 aa  300  4e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  38.81 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  34.32 
 
 		 406 aa  267  2e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  33.73 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  33.25 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  32.22 
 
 		 398 aa  221  3e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  29.9 
 
 		 441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  31.42 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  28.85 
 
 		 470 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  30.5 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  28.8 
 
 		 488 aa  172  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  28.53 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  29.06 
 
 		 465 aa  169  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  27.9 
 
 		 471 aa  169  8e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  28.83 
 
 		 464 aa  169  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  26.46 
 
 		 469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 		 464 aa  167  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 		 465 aa  166  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 		 465 aa  166  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  28.78 
 
 		 469 aa  166  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  28.46 
 
 		 472 aa  163  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  26.21 
 
 		 468 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  28.07 
 
 		 472 aa  161  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  26.46 
 
 		 472 aa  160  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  28.53 
 
 		 470 aa  159  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  28.26 
 
 		 465 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  28.26 
 
 		 465 aa  159  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  28.26 
 
 		 465 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  26.08 
 
 		 467 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  28.26 
 
 		 465 aa  159  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  28.26 
 
 		 465 aa  159  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  28.26 
 
 		 465 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  28.26 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  29.47 
 
 		 473 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  28.02 
 
 		 465 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  28.26 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  28.33 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  27.32 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  27.51 
 
 		 470 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  30.28 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  27.23 
 
 		 472 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  26.98 
 
 		 476 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  26.98 
 
 		 476 aa  156  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.2 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  28.68 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  28.43 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  27.96 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  26.65 
 
 		 480 aa  154  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  27.29 
 
 		 465 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  25.72 
 
 		 470 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  28.82 
 
 		 479 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  27.54 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  25.98 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  25.98 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  25.81 
 
 		 475 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  26.39 
 
 		 479 aa  150  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  27.29 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  25.47 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_004310  BR0931  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.54 
 
 		 507 aa  150  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122156  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  26.32 
 
 		 476 aa  149  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2255  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.54 
 
 		 507 aa  150  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.03 
 
 		 469 aa  149  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  27.76 
 
 		 466 aa  149  8e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  26.36 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  26.12 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  25.72 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  26.18 
 
 		 481 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  25.58 
 
 		 470 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0925  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.25 
 
 		 507 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  26.18 
 
 		 481 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  24.75 
 
 		 474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  25.97 
 
 		 479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  25.35 
 
 		 476 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  25.52 
 
 		 485 aa  146  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>