More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0951 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  84.17 
 
 
398 aa  691    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  100 
 
 
398 aa  787    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  75.88 
 
 
397 aa  624  1e-178  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  43.35 
 
 
406 aa  267  2e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  37.66 
 
 
411 aa  260  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  35 
 
 
416 aa  255  7e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  37.73 
 
 
407 aa  243  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  36.04 
 
 
407 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  33.09 
 
 
408 aa  237  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  33.82 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  35.32 
 
 
403 aa  229  9e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  33.33 
 
 
408 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  36.99 
 
 
408 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  37.27 
 
 
411 aa  222  9e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  31.98 
 
 
408 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  36.96 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  38.91 
 
 
386 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  35.48 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  35.69 
 
 
394 aa  216  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  33.25 
 
 
407 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  36.6 
 
 
396 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  37.28 
 
 
393 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  38.44 
 
 
387 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  37.95 
 
 
388 aa  206  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  34.12 
 
 
384 aa  204  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  35.02 
 
 
369 aa  203  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  35.63 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  34.14 
 
 
371 aa  199  9e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  34.19 
 
 
369 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  37.43 
 
 
388 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  36 
 
 
368 aa  186  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  32.18 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  29.1 
 
 
463 aa  146  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  29.69 
 
 
441 aa  142  9e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  28.29 
 
 
469 aa  136  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  29 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  28.76 
 
 
464 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  28.76 
 
 
464 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  28.95 
 
 
469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  29.58 
 
 
467 aa  131  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  28.81 
 
 
470 aa  130  6e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  27.41 
 
 
474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  25.19 
 
 
472 aa  125  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  28.85 
 
 
468 aa  123  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  28.52 
 
 
466 aa  122  8e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.22 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  27.33 
 
 
470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  27.34 
 
 
472 aa  119  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  26.83 
 
 
465 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  28.16 
 
 
488 aa  118  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  27.36 
 
 
470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  25.44 
 
 
465 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4169  FeS assembly protein SufB  28.38 
 
 
486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.274482  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  27.43 
 
 
467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  26.48 
 
 
465 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  24.76 
 
 
472 aa  116  6.9999999999999995e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  25.69 
 
 
470 aa  116  6.9999999999999995e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  25.78 
 
 
465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  25.78 
 
 
465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1078  FeS assembly protein SufB  26.21 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000122877  normal  0.697067 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  27.94 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  28.76 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  25.44 
 
 
463 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.01 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  25.44 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  25.44 
 
 
465 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  25.44 
 
 
465 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.43 
 
 
470 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  25.44 
 
 
465 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  25.44 
 
 
465 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  25.61 
 
 
465 aa  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  25.44 
 
 
465 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  25.61 
 
 
465 aa  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  25.44 
 
 
465 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  25.44 
 
 
465 aa  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  27.46 
 
 
470 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.44 
 
 
482 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  24.83 
 
 
475 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0761  FeS assembly protein SufB  28.44 
 
 
474 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.561648  normal  0.362829 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  28.43 
 
 
499 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1745  FeS assembly protein SufB  28.44 
 
 
474 aa  110  5e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  25.76 
 
 
470 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  25.23 
 
 
483 aa  109  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  25.35 
 
 
469 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  28.43 
 
 
477 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0488  FeS assembly protein SufB  24.94 
 
 
478 aa  108  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.8001  normal  0.461804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  26.1 
 
 
480 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  25.52 
 
 
465 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  26.04 
 
 
479 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  27.08 
 
 
471 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  28.62 
 
 
471 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  25.17 
 
 
476 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0084  FeS assembly protein SufB  25 
 
 
494 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.597876 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  27.18 
 
 
552 aa  107  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  25.61 
 
 
469 aa  106  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  27.08 
 
 
471 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  25.76 
 
 
470 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  25.17 
 
 
476 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  24.92 
 
 
466 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0613  FeS assembly protein SufB  26.88 
 
 
473 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>