More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2224 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  100 
 
 		 370 aa  763    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  68.98 
 
 		 369 aa  513  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  61.88 
 
 		 371 aa  481  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  63.26 
 
 		 369 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  50.14 
 
 		 390 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  51.54 
 
 		 411 aa  382  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  51.1 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  50.97 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  50.27 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  50.98 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  47.95 
 
 		 388 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  48.36 
 
 		 386 aa  364  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  48.19 
 
 		 393 aa  362  8e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  50 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  49.58 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  46.2 
 
 		 407 aa  341  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  45.33 
 
 		 387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  44.54 
 
 		 384 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  46.72 
 
 		 407 aa  334  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  46.01 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  45.73 
 
 		 396 aa  322  8e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  45.18 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  44.17 
 
 		 408 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  44.63 
 
 		 406 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  45 
 
 		 368 aa  311  7.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  44.29 
 
 		 403 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  41.14 
 
 		 416 aa  296  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  38.07 
 
 		 411 aa  276  6e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  35.16 
 
 		 406 aa  219  6e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  33.43 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  32.81 
 
 		 398 aa  176  5e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  32.18 
 
 		 398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  31.92 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  31.37 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  31.37 
 
 		 464 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  31.63 
 
 		 471 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  31.71 
 
 		 463 aa  150  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  30.93 
 
 		 469 aa  143  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  30.51 
 
 		 470 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  27.93 
 
 		 471 aa  138  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  30.28 
 
 		 488 aa  136  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  28.75 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  29.79 
 
 		 470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  33.96 
 
 		 465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  28.41 
 
 		 475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  30.57 
 
 		 471 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  27.56 
 
 		 475 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  33.21 
 
 		 465 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  33.21 
 
 		 465 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  31.7 
 
 		 476 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  31.33 
 
 		 465 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  26.84 
 
 		 483 aa  127  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  28.41 
 
 		 476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  28.22 
 
 		 472 aa  126  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  28.42 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  27.49 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  26.86 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  31.85 
 
 		 465 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  32.08 
 
 		 469 aa  123  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  31.85 
 
 		 465 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  32.08 
 
 		 465 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  32.08 
 
 		 465 aa  123  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  32.08 
 
 		 465 aa  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  30.67 
 
 		 465 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  32.08 
 
 		 463 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  32.08 
 
 		 465 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  32.08 
 
 		 465 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  32.08 
 
 		 465 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  31.7 
 
 		 465 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  28.98 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  32.08 
 
 		 465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  31.32 
 
 		 472 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  29.06 
 
 		 476 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.3 
 
 		 469 aa  119  7.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  28.92 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 		 479 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  28.94 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  29.02 
 
 		 485 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  29.06 
 
 		 476 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.83 
 
 		 482 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  30.38 
 
 		 465 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  27.25 
 
 		 470 aa  117  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.91 
 
 		 470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1078  FeS assembly protein SufB  26.63 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000122877  normal  0.697067 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  28.41 
 
 		 469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.82 
 
 		 472 aa  116  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4469  FeS assembly protein SufB  26.67 
 
 		 490 aa  116  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  31.58 
 
 		 487 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  29.23 
 
 		 479 aa  115  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  27.97 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  28.12 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  27.65 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.93 
 
 		 470 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  28 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  28.62 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  28.17 
 
 		 466 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.37 
 
 		 490 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  27.13 
 
 		 480 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  30.83 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  28.16 
 
 		 481 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>