More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0259 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  100 
 
 		 371 aa  763    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  63.46 
 
 		 369 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  61.88 
 
 		 370 aa  481  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  62.36 
 
 		 369 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  53.64 
 
 		 411 aa  398  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  53.42 
 
 		 411 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  53.09 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  52.5 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  52.02 
 
 		 411 aa  389  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  50.14 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  50.55 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  49.58 
 
 		 386 aa  364  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  49.43 
 
 		 388 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  48.6 
 
 		 393 aa  359  5e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  48.75 
 
 		 384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  50.57 
 
 		 388 aa  349  5e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  47.9 
 
 		 407 aa  345  6e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  45.18 
 
 		 387 aa  339  5e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  48.01 
 
 		 403 aa  338  9e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  46.2 
 
 		 407 aa  330  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  44.94 
 
 		 368 aa  327  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  47.09 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  45 
 
 		 408 aa  315  8e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  46.24 
 
 		 396 aa  315  9e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  44.57 
 
 		 408 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  45.53 
 
 		 416 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  45.4 
 
 		 408 aa  309  4e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  41.6 
 
 		 411 aa  291  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  35.66 
 
 		 406 aa  230  3e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  36.14 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  34.14 
 
 		 398 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  34.44 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  33.33 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  29.6 
 
 		 471 aa  135  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  32.58 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  27.27 
 
 		 441 aa  133  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  33.58 
 
 		 464 aa  133  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  31.65 
 
 		 463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  33.58 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  29.23 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  28.27 
 
 		 469 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  28.15 
 
 		 471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  33.46 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  29.85 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  28.53 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  34.33 
 
 		 469 aa  124  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  30.83 
 
 		 471 aa  123  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  32.71 
 
 		 465 aa  122  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  33.46 
 
 		 465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  33.46 
 
 		 465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  32.33 
 
 		 465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  32.33 
 
 		 463 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  33.08 
 
 		 465 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  32.33 
 
 		 465 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  32.71 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  32.33 
 
 		 465 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  32.33 
 
 		 465 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  32.33 
 
 		 465 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  32.33 
 
 		 465 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  32.33 
 
 		 465 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  32.33 
 
 		 465 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  32.33 
 
 		 465 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  32.33 
 
 		 465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.95 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  32.02 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  30.19 
 
 		 476 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.08 
 
 		 469 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  25.9 
 
 		 480 aa  116  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  28.53 
 
 		 470 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  27.96 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.45 
 
 		 490 aa  115  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  25.07 
 
 		 479 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  27.38 
 
 		 475 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  27.6 
 
 		 476 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  28.32 
 
 		 470 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  27.42 
 
 		 474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  28.32 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  28.94 
 
 		 479 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  26.63 
 
 		 476 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  27.96 
 
 		 470 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  28.84 
 
 		 470 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.6 
 
 		 483 aa  110  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  28.3 
 
 		 475 aa  109  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.84 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.24 
 
 		 482 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  27.24 
 
 		 470 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  28.2 
 
 		 479 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  25.07 
 
 		 485 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  28.32 
 
 		 485 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  29.3 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  27.24 
 
 		 487 aa  107  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  27.76 
 
 		 470 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  30.11 
 
 		 468 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  27.96 
 
 		 478 aa  106  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  25.07 
 
 		 485 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  29.26 
 
 		 472 aa  106  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  28.62 
 
 		 472 aa  106  8e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  26.88 
 
 		 487 aa  106  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  28.09 
 
 		 466 aa  105  9e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>