More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0318 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  100 
 
 
406 aa  829    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  68.89 
 
 
408 aa  610  1e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  67.41 
 
 
408 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  66.91 
 
 
408 aa  580  1e-164  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  69.13 
 
 
396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  48.39 
 
 
407 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  45.02 
 
 
416 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  44.23 
 
 
407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  46.35 
 
 
411 aa  351  2e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  46.13 
 
 
411 aa  350  3e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  44.47 
 
 
407 aa  347  3e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  45.62 
 
 
411 aa  345  8e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  46.98 
 
 
390 aa  345  8e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  43.38 
 
 
408 aa  339  5e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  43.69 
 
 
403 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  47.28 
 
 
393 aa  330  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  44.25 
 
 
411 aa  325  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  43.04 
 
 
388 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  44.5 
 
 
386 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  47.09 
 
 
371 aa  317  3e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  44.63 
 
 
370 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  43.53 
 
 
369 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  43.73 
 
 
394 aa  306  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  40 
 
 
387 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  40.66 
 
 
384 aa  294  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  43.85 
 
 
388 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  42.78 
 
 
369 aa  287  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  39.55 
 
 
368 aa  276  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  34.47 
 
 
406 aa  271  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  36.5 
 
 
397 aa  252  8.000000000000001e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  34.47 
 
 
398 aa  232  8.000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  33.09 
 
 
398 aa  229  8e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  31.1 
 
 
463 aa  181  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  32.19 
 
 
469 aa  180  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  29.8 
 
 
467 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  30.97 
 
 
488 aa  178  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  29.23 
 
 
470 aa  177  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  30 
 
 
441 aa  175  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  30.67 
 
 
465 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  30.05 
 
 
469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  30.91 
 
 
464 aa  172  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  29.32 
 
 
471 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  30.65 
 
 
464 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  29.83 
 
 
465 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  29.83 
 
 
465 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  29.79 
 
 
471 aa  168  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  29.28 
 
 
467 aa  167  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  29.69 
 
 
483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  28.74 
 
 
465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  28.74 
 
 
465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  28.74 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  28.5 
 
 
465 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  28.5 
 
 
465 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  28.5 
 
 
465 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  28.5 
 
 
463 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  30.52 
 
 
479 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  27.61 
 
 
472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  28.34 
 
 
472 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  28.5 
 
 
465 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  28.5 
 
 
465 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  28.26 
 
 
465 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3262  FeS assembly protein SufB  28.47 
 
 
482 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47258  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  29.12 
 
 
470 aa  160  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  26.04 
 
 
474 aa  160  4e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  28.02 
 
 
465 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  29.48 
 
 
465 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  28.17 
 
 
466 aa  159  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  27.62 
 
 
476 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  29.48 
 
 
465 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  25.36 
 
 
475 aa  157  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0931  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.45 
 
 
507 aa  157  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  28.74 
 
 
465 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2255  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.45 
 
 
507 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4469  FeS assembly protein SufB  30.09 
 
 
490 aa  156  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0925  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.45 
 
 
507 aa  155  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  28 
 
 
476 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  26.57 
 
 
476 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0810  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.75 
 
 
503 aa  155  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0422857  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  26.12 
 
 
476 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1608  FeS assembly protein SufB  26.33 
 
 
490 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0033027 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  26.72 
 
 
476 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  26.67 
 
 
469 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  28.8 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.76 
 
 
472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01357  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  28.35 
 
 
478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.456258  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  27.93 
 
 
468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0098  FeS assembly protein SufB  28.88 
 
 
506 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.782387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0084  FeS assembly protein SufB  28.1 
 
 
494 aa  154  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.597876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  26.84 
 
 
472 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1414  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.4 
 
 
479 aa  154  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.80589  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3977  FeS assembly protein SufB  29.61 
 
 
489 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.229851  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  26.67 
 
 
470 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  25.93 
 
 
472 aa  153  5e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2435  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  28.4 
 
 
489 aa  153  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2107  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  28.48 
 
 
489 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862611  normal  0.0704835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  27.08 
 
 
480 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1900  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  28.48 
 
 
489 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000572283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4457  FeS assembly protein SufB  29.61 
 
 
489 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985425  normal  0.145425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  26.4 
 
 
479 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4345  FeS assembly protein SufB  29 
 
 
489 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>