More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1554 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  100 
 
 		 411 aa  838    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  49.75 
 
 		 416 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  44.94 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  45.36 
 
 		 407 aa  358  9e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  47.13 
 
 		 408 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  44.78 
 
 		 407 aa  355  1e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  47.29 
 
 		 393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  44.06 
 
 		 408 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  47.41 
 
 		 390 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  42.61 
 
 		 411 aa  335  5.999999999999999e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  45.3 
 
 		 408 aa  335  1e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  42.61 
 
 		 411 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  43.81 
 
 		 408 aa  332  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  42.75 
 
 		 411 aa  331  1e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  44.25 
 
 		 406 aa  325  1e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  44.08 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  44.05 
 
 		 388 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  44.32 
 
 		 386 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  42.16 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  42.66 
 
 		 387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  38.52 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  39.74 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  43.78 
 
 		 388 aa  293  5e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  41.6 
 
 		 371 aa  291  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  40.16 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  41.06 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  38.07 
 
 		 370 aa  276  7e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  37.3 
 
 		 369 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  37.38 
 
 		 406 aa  269  7e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  38.4 
 
 		 398 aa  263  4e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  37.68 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  37.41 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  30.48 
 
 		 441 aa  186  5e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.53 
 
 		 490 aa  157  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  29.89 
 
 		 469 aa  157  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  28.08 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  28.68 
 
 		 470 aa  153  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.68 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  28.71 
 
 		 472 aa  152  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  29.94 
 
 		 463 aa  150  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  28.74 
 
 		 467 aa  150  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  27.25 
 
 		 470 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  25 
 
 		 472 aa  149  8e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  28.21 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  26.9 
 
 		 471 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  27.34 
 
 		 481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  27.42 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  27.88 
 
 		 471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  27.72 
 
 		 472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  27.27 
 
 		 470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.42 
 
 		 470 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  28.06 
 
 		 466 aa  146  8.000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  27.71 
 
 		 470 aa  145  9e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  26.58 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  25.94 
 
 		 470 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  27.96 
 
 		 470 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.84 
 
 		 482 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  28.09 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  25.76 
 
 		 487 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  26.95 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  27.02 
 
 		 487 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  26.58 
 
 		 470 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  25.76 
 
 		 487 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  25.76 
 
 		 487 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  28.09 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  26.49 
 
 		 467 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  26.77 
 
 		 487 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  26.89 
 
 		 476 aa  144  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  26.2 
 
 		 476 aa  143  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  27.66 
 
 		 471 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  25.51 
 
 		 479 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  27.06 
 
 		 472 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  26.43 
 
 		 475 aa  143  7e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  25.25 
 
 		 479 aa  142  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  26.72 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  27.37 
 
 		 471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  26.7 
 
 		 485 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  26.01 
 
 		 480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  28.16 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  26.84 
 
 		 479 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  25.75 
 
 		 472 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  28.65 
 
 		 471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  25.68 
 
 		 470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.54 
 
 		 469 aa  140  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  25.47 
 
 		 471 aa  139  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  26.52 
 
 		 481 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  25 
 
 		 483 aa  138  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  26.58 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.53 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  27.86 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  25.4 
 
 		 552 aa  136  7.000000000000001e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  29.8 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  29.63 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  25.25 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  29.8 
 
 		 465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  25.94 
 
 		 479 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1111  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  27.3 
 
 		 462 aa  134  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  25.23 
 
 		 472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  25.19 
 
 		 477 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  28.98 
 
 		 465 aa  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>