More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1973 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  85.05 
 
 		 388 aa  690    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  77.72 
 
 		 386 aa  638    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  100 
 
 		 388 aa  798    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  68.99 
 
 		 387 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  65.9 
 
 		 393 aa  537  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  64.94 
 
 		 390 aa  537  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  54.09 
 
 		 384 aa  458  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  53.55 
 
 		 408 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  51.2 
 
 		 411 aa  397  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  50.27 
 
 		 407 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  50.93 
 
 		 411 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  52.51 
 
 		 411 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  54.8 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  50.27 
 
 		 370 aa  381  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  52.5 
 
 		 369 aa  381  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  50.57 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  49.72 
 
 		 369 aa  364  1e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  46.95 
 
 		 407 aa  358  8e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  46.42 
 
 		 407 aa  358  8e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  44.94 
 
 		 416 aa  341  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  44.13 
 
 		 403 aa  340  2e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  44.97 
 
 		 408 aa  335  1e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  43.24 
 
 		 408 aa  330  2e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  43.65 
 
 		 396 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  43.24 
 
 		 408 aa  326  5e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  43.85 
 
 		 406 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  42.86 
 
 		 411 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  45.51 
 
 		 368 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  37.31 
 
 		 397 aa  224  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  33.59 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  39.94 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  38.79 
 
 		 398 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  31.23 
 
 		 470 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  33.13 
 
 		 471 aa  157  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  31.44 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  30.97 
 
 		 464 aa  152  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  30.97 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  30 
 
 		 441 aa  150  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  31.15 
 
 		 463 aa  150  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  32.68 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  27.73 
 
 		 471 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  31.68 
 
 		 465 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  31.07 
 
 		 471 aa  142  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  28.92 
 
 		 474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  31.02 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  31.07 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  29.44 
 
 		 468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  29.61 
 
 		 469 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  30.83 
 
 		 471 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  30.94 
 
 		 465 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  30.94 
 
 		 465 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  30.03 
 
 		 463 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  29.57 
 
 		 472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  30.03 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  30.03 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  30.03 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  30.03 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  30.03 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  30.03 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  30.03 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  30.03 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  30.03 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  31.45 
 
 		 488 aa  135  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  30.36 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  30.25 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  28.44 
 
 		 475 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  29.63 
 
 		 465 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  28.49 
 
 		 472 aa  134  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  28.81 
 
 		 465 aa  133  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  28.69 
 
 		 469 aa  133  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  27.87 
 
 		 466 aa  133  6e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  30.96 
 
 		 475 aa  133  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 		 470 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  31.32 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  29.89 
 
 		 476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  28.85 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  27.3 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  29.45 
 
 		 473 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  32.03 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  31.39 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  25.86 
 
 		 479 aa  125  9e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.85 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  26.6 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  29.47 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  30.74 
 
 		 470 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  26.24 
 
 		 470 aa  122  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0488  FeS assembly protein SufB  25.63 
 
 		 478 aa  122  9e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.8001  normal  0.461804 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.05 
 
 		 470 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  27.05 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  28.68 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.61 
 
 		 469 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  29.12 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  25.62 
 
 		 481 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  26.67 
 
 		 470 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1078  FeS assembly protein SufB  26.74 
 
 		 471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000122877  normal  0.697067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  26.35 
 
 		 487 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  26.35 
 
 		 487 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  26.35 
 
 		 487 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.37 
 
 		 482 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0613  FeS assembly protein SufB  26.06 
 
 		 473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>