More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_720 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  96.11 
 
 		 411 aa  830    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  100 
 
 		 411 aa  852    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  96.59 
 
 		 411 aa  831    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  55.67 
 
 		 407 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  52.09 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  55.92 
 
 		 390 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  51.17 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  55 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  51 
 
 		 403 aa  409  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  51.6 
 
 		 386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  49.62 
 
 		 407 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  53.91 
 
 		 388 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  53.04 
 
 		 369 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  53.95 
 
 		 369 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  49.37 
 
 		 407 aa  395  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  53.42 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  50.98 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  48.28 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  52.51 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  47.81 
 
 		 408 aa  360  2e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  48.02 
 
 		 368 aa  356  5e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  44.06 
 
 		 416 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  46.13 
 
 		 406 aa  350  3e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  47.92 
 
 		 384 aa  341  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  45.1 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  42.61 
 
 		 411 aa  334  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  44.73 
 
 		 408 aa  333  2e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  44.19 
 
 		 408 aa  331  1e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  38.51 
 
 		 406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  34.11 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  36.07 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  33.92 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  32.14 
 
 		 467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  31.2 
 
 		 470 aa  166  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  30.27 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  30.05 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  30.25 
 
 		 471 aa  157  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  30.33 
 
 		 464 aa  156  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  30.33 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  29.51 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  29.71 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  28.42 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  29.58 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  28.61 
 
 		 465 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  32.85 
 
 		 475 aa  145  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  30.62 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  29.63 
 
 		 475 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  32.49 
 
 		 476 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  28.36 
 
 		 465 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  27.65 
 
 		 474 aa  143  7e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  28.42 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  28.42 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  28.17 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  28.17 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  27.65 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  28.17 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  28.17 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  27.91 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  28.17 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  28.17 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  28.17 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  28.16 
 
 		 472 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  30.64 
 
 		 476 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  29.15 
 
 		 472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.55 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  29.65 
 
 		 470 aa  137  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  27.83 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  27.83 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.87 
 
 		 490 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.25 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  27.15 
 
 		 483 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  31.41 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  27.25 
 
 		 468 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  28.12 
 
 		 473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  28.49 
 
 		 469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.51 
 
 		 470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  27.79 
 
 		 487 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 		 472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  29.55 
 
 		 477 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.41 
 
 		 483 aa  133  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  27.58 
 
 		 476 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  27.79 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  26.52 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  27.09 
 
 		 465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  27.03 
 
 		 467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 		 466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  28.16 
 
 		 481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  29.51 
 
 		 471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  26.99 
 
 		 487 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  26.99 
 
 		 487 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  26.99 
 
 		 487 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  27.88 
 
 		 476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  28.79 
 
 		 470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  26.93 
 
 		 481 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  29.6 
 
 		 476 aa  130  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.16 
 
 		 482 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  30.13 
 
 		 470 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  27.47 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1078  FeS assembly protein SufB  28.79 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000122877  normal  0.697067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  27.66 
 
 		 470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>