More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1444 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  800    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  76.17 
 
 		 388 aa  641    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  77.72 
 
 		 388 aa  608  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  68.99 
 
 		 387 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  64.42 
 
 		 393 aa  530  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  61.2 
 
 		 390 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  51.98 
 
 		 384 aa  438  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  52.39 
 
 		 411 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  52.39 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  51.6 
 
 		 411 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  51.37 
 
 		 408 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  48.8 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  55.08 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  51.12 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  50.56 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  49.58 
 
 		 371 aa  364  1e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  48.36 
 
 		 370 aa  364  1e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  46.56 
 
 		 407 aa  355  1e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  45.93 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  43.86 
 
 		 403 aa  352  8e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  44.94 
 
 		 416 aa  343  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  44.56 
 
 		 408 aa  335  1e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  45.66 
 
 		 368 aa  327  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  42.97 
 
 		 408 aa  319  5e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  44.5 
 
 		 406 aa  318  7e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  44.32 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  42.97 
 
 		 396 aa  315  7e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  42.44 
 
 		 408 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  37.04 
 
 		 406 aa  224  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  37.24 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  38.91 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  39.67 
 
 		 398 aa  211  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  29.63 
 
 		 441 aa  160  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  29.97 
 
 		 471 aa  158  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  29.85 
 
 		 470 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  29.78 
 
 		 471 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  31.03 
 
 		 467 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  30.09 
 
 		 463 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  28.45 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  28.15 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  32.2 
 
 		 465 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  26.87 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  28.45 
 
 		 468 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  31.19 
 
 		 465 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  29.5 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  30.67 
 
 		 488 aa  144  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  30 
 
 		 465 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  30 
 
 		 465 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  31.73 
 
 		 472 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  30.51 
 
 		 463 aa  142  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  30.51 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  30.51 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  30.17 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  30.51 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  30.17 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  30.51 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  28.87 
 
 		 472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  30.51 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  30.51 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  27.38 
 
 		 475 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  25.76 
 
 		 474 aa  140  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  30.1 
 
 		 472 aa  139  7e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  29.89 
 
 		 483 aa  138  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  29.24 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  30.48 
 
 		 467 aa  136  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  28.21 
 
 		 476 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  28.53 
 
 		 476 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.7 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  30.7 
 
 		 471 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  28.12 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  29.02 
 
 		 470 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1111  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  28.96 
 
 		 462 aa  133  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  28.12 
 
 		 472 aa  133  6e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  30.03 
 
 		 471 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  28.31 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  28.24 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  28.53 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  27.36 
 
 		 466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  26.88 
 
 		 479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  27.73 
 
 		 487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  28.08 
 
 		 481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  27.73 
 
 		 487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  29.44 
 
 		 471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  27.95 
 
 		 485 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  27.73 
 
 		 487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  28.3 
 
 		 485 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  28.8 
 
 		 469 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  28.08 
 
 		 470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  28.39 
 
 		 473 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  29.25 
 
 		 465 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  29.25 
 
 		 465 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.02 
 
 		 470 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  27.41 
 
 		 479 aa  130  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  27.1 
 
 		 479 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  27.44 
 
 		 499 aa  129  7.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  27.9 
 
 		 487 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  30.07 
 
 		 465 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  27.67 
 
 		 480 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.86 
 
 		 482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  28.44 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>