More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0535 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  100 
 
 		 403 aa  823    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  53.48 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  51.99 
 
 		 411 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  51 
 
 		 411 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  51 
 
 		 411 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  46.45 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  46.04 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  47.49 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  49.57 
 
 		 369 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  43.61 
 
 		 408 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  43.86 
 
 		 386 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  47.01 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  45.91 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  45.21 
 
 		 390 aa  349  6e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  50 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  43.88 
 
 		 408 aa  343  4e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  44.13 
 
 		 396 aa  342  8e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  43.86 
 
 		 408 aa  341  2e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  48.01 
 
 		 371 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  43.69 
 
 		 406 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  42.72 
 
 		 416 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  43.41 
 
 		 387 aa  329  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  41.55 
 
 		 384 aa  322  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  44.99 
 
 		 369 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  44.13 
 
 		 388 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  38.52 
 
 		 411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  44.66 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  44.29 
 
 		 370 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  38.87 
 
 		 397 aa  253  3e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  35.98 
 
 		 406 aa  247  3e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  35.44 
 
 		 398 aa  225  9e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  34.83 
 
 		 398 aa  224  3e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  34.95 
 
 		 464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  34.68 
 
 		 464 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  33.33 
 
 		 463 aa  189  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  33.09 
 
 		 467 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  31.89 
 
 		 469 aa  185  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  31.38 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  32.7 
 
 		 470 aa  182  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  32.96 
 
 		 471 aa  182  9.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  29.95 
 
 		 470 aa  179  7e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  29.41 
 
 		 465 aa  176  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  29.41 
 
 		 465 aa  176  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  30.96 
 
 		 471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  29.82 
 
 		 552 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  29.74 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  29.5 
 
 		 468 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  29.67 
 
 		 472 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  31.17 
 
 		 471 aa  170  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  30.57 
 
 		 499 aa  168  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.68 
 
 		 469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  30.94 
 
 		 469 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  31.77 
 
 		 472 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  28.86 
 
 		 472 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  30.17 
 
 		 476 aa  166  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.86 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.57 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  29.7 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  28.46 
 
 		 465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  28.46 
 
 		 465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  29.95 
 
 		 475 aa  164  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  28.64 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  31.56 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  31.77 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  28.39 
 
 		 465 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  28.39 
 
 		 465 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  32.88 
 
 		 470 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  28.39 
 
 		 463 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  28.39 
 
 		 465 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  28.39 
 
 		 465 aa  163  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  28.39 
 
 		 465 aa  162  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  28.39 
 
 		 465 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  30.42 
 
 		 487 aa  162  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  31.77 
 
 		 485 aa  162  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  29.67 
 
 		 465 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  31.49 
 
 		 482 aa  162  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  28.39 
 
 		 465 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  31.77 
 
 		 471 aa  162  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  29.68 
 
 		 476 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  31.33 
 
 		 488 aa  162  9e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  28.78 
 
 		 465 aa  162  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  29.68 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  30.25 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  29.9 
 
 		 487 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.08 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  29.43 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.37 
 
 		 470 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  28.32 
 
 		 469 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  30.63 
 
 		 469 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  29.05 
 
 		 479 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  28.5 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  31.97 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  30.3 
 
 		 485 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  31.97 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  31.97 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  28.72 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  29.1 
 
 		 472 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  31.69 
 
 		 479 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  31.13 
 
 		 481 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  28.39 
 
 		 483 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>