More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0670 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  760    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  62.36 
 
 		 371 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  63.26 
 
 		 370 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  63.29 
 
 		 369 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  53.83 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  53.01 
 
 		 411 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  53.04 
 
 		 411 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  53.22 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  51.91 
 
 		 393 aa  381  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  51.52 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  51.99 
 
 		 394 aa  378  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  48.88 
 
 		 408 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  51.12 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  48.9 
 
 		 407 aa  368  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  50.56 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  49.05 
 
 		 387 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  52.5 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  49.57 
 
 		 403 aa  355  5e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  46.41 
 
 		 407 aa  353  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  46.26 
 
 		 384 aa  354  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  47.78 
 
 		 368 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  43.99 
 
 		 408 aa  316  3e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  43.53 
 
 		 406 aa  309  5e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  44.44 
 
 		 416 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  42.9 
 
 		 396 aa  305  7e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  42.9 
 
 		 408 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  41.26 
 
 		 408 aa  301  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  40.16 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  39.94 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  37.22 
 
 		 397 aa  212  9e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  35.02 
 
 		 398 aa  203  4e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  35.33 
 
 		 398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  33.14 
 
 		 464 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  32.62 
 
 		 463 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  32.29 
 
 		 471 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  34.63 
 
 		 464 aa  155  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  28.92 
 
 		 471 aa  152  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  30.31 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  29.2 
 
 		 441 aa  150  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.88 
 
 		 469 aa  149  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  30.81 
 
 		 471 aa  149  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  30.03 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  30.39 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  32.88 
 
 		 465 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  32.88 
 
 		 465 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  29.38 
 
 		 476 aa  146  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  29.75 
 
 		 470 aa  146  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  32.2 
 
 		 465 aa  146  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  29.01 
 
 		 480 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  30.72 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  29.69 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.94 
 
 		 490 aa  143  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  31.38 
 
 		 465 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  29.06 
 
 		 476 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.32 
 
 		 470 aa  143  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  30.64 
 
 		 465 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  29.69 
 
 		 479 aa  143  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.38 
 
 		 482 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  29.91 
 
 		 487 aa  142  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  30.11 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  30.64 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  29.45 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  29.45 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  29.45 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  29.45 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  29.6 
 
 		 487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  29.45 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  29.45 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  29.66 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  29.66 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  29.45 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  29.45 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  29.15 
 
 		 466 aa  140  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  29.45 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.47 
 
 		 483 aa  139  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  29.38 
 
 		 470 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  28.75 
 
 		 479 aa  139  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  29.69 
 
 		 478 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  30.2 
 
 		 472 aa  138  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  28.75 
 
 		 485 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  30.98 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.81 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  29.87 
 
 		 473 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  27.81 
 
 		 481 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.38 
 
 		 470 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  30.84 
 
 		 471 aa  136  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  28.75 
 
 		 470 aa  135  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.15 
 
 		 475 aa  135  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  28.71 
 
 		 552 aa  135  8e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.41 
 
 		 472 aa  135  9e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  29.47 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  28.12 
 
 		 481 aa  135  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.9 
 
 		 482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  30.84 
 
 		 471 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  29.38 
 
 		 470 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  29.78 
 
 		 483 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  28.43 
 
 		 475 aa  134  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  28.3 
 
 		 476 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  30.19 
 
 		 472 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  27.5 
 
 		 485 aa  133  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>