More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0116 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0116  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  494  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0979566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4497  ABC transporter related protein  54.77 
 
 
256 aa  215  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76091  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1968  ABC transporter related protein  54.44 
 
 
243 aa  205  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.384614  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03980  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  46.27 
 
 
328 aa  178  8e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.831895  normal  0.159465 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0868  dipeptide transport ATP-binding protein DppD  38.68 
 
 
336 aa  159  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  41.86 
 
 
606 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2406  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.08 
 
 
744 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  39.54 
 
 
324 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188886  normal  0.0439105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  40.93 
 
 
538 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  42.17 
 
 
547 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1852  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 
325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1893  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.75 
 
 
322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000746649  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2380  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.55 
 
 
331 aa  152  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0497276  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  40.54 
 
 
534 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1298  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.3 
 
 
327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  40.68 
 
 
543 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  41.35 
 
 
540 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0671  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.58 
 
 
321 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642349  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2989  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 
333 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1998  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.13 
 
 
333 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.120304  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5352  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.25 
 
 
350 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2628  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.4 
 
 
334 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.607562  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2602  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.38 
 
 
355 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2384  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.77 
 
 
346 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0779922  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  41.08 
 
 
540 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5775  ABC transporter related protein  42.98 
 
 
257 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal  0.641423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  42.91 
 
 
326 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0888  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.75 
 
 
331 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1243  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  39.92 
 
 
320 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143149  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2148  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.06 
 
 
675 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.770476  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0938  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.42 
 
 
332 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1093  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39 
 
 
356 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4282  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.23 
 
 
330 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.897477 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0426  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.33 
 
 
321 aa  149  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.16 
 
 
325 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.35 
 
 
564 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  39.24 
 
 
541 aa  149  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0447  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.93 
 
 
335 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0930443 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0690  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.16 
 
 
338 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0222282 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0212  hypothetical protein  35.95 
 
 
334 aa  148  7e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0203  hypothetical protein  35.95 
 
 
334 aa  148  7e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0435  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.27 
 
 
330 aa  148  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.25 
 
 
342 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.467741  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  42.92 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001851  oligopeptide transport ATP-binding protein OppD  37.5 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00642  ABC transporter ATPase component  37.92 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0751  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.8 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.726044  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.98 
 
 
370 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6653  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.35 
 
 
340 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0018  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.96 
 
 
332 aa  146  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5119  putative ABC transporter ATP-binding  40.76 
 
 
327 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  0.157884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0209  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.93 
 
 
331 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 
544 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1327  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.96 
 
 
322 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0010224  normal  0.375909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4141  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  38.46 
 
 
344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.22 
 
 
571 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3018  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.11 
 
 
335 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242657  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2755  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.75 
 
 
327 aa  145  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2800  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.53 
 
 
322 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3079  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  39.16 
 
 
334 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41088  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4369  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.77 
 
 
336 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  0.634457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  38.37 
 
 
276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  42.41 
 
 
631 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.8 
 
 
328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.97058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0258  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.06 
 
 
369 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21107  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1016  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.35 
 
 
662 aa  145  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0944  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.98 
 
 
338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  39.51 
 
 
527 aa  144  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3463  ABC transporter related  45.29 
 
 
546 aa  144  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.363207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  44.12 
 
 
575 aa  145  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  40 
 
 
563 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0451  ATPase  41.53 
 
 
552 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.508164  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  43.38 
 
 
276 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  40.93 
 
 
534 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0842  ABC transporter related  42.37 
 
 
593 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0423448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  37.04 
 
 
619 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  39.58 
 
 
611 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.39 
 
 
331 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4210  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.84 
 
 
345 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0907  putative ATP-binding component of dipeptide transport system  39.83 
 
 
318 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000823752  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1883  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.14 
 
 
323 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2851  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 
341 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0866  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.3 
 
 
331 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  38.49 
 
 
571 aa  143  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1971  ABC transporter related  40.6 
 
 
295 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3820  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.84 
 
 
345 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.135433  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2787  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.85 
 
 
327 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3651  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.06 
 
 
349 aa  143  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3548  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.93 
 
 
343 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.927154  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  37.97 
 
 
542 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0618  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.09 
 
 
725 aa  143  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726649  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39 
 
 
610 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2029  ABC transporter, ATP-binding protein  32.41 
 
 
355 aa  142  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4383  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.59 
 
 
330 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.0305999999999999e-22 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0451  ABC transporter related  39.17 
 
 
597 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36500  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  39.24 
 
 
332 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.632882  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.78 
 
 
661 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2159  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.02 
 
 
684 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13006  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3476  ABC transporter related  42.02 
 
 
594 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0289183  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0219  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.8 
 
 
352 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.580766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>