More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1971 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1971  ABC transporter related  100 
 
 
295 aa  578  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7171  peptide ABC transporter ATP-binding protein  54.9 
 
 
291 aa  285  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2995  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.86 
 
 
330 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2643  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.74 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.791522  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  45.07 
 
 
531 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0907  putative ATP-binding component of dipeptide transport system  42.66 
 
 
318 aa  232  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000823752  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.14 
 
 
596 aa  231  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3105  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.45 
 
 
351 aa  231  9e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  48.06 
 
 
619 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0258  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.99 
 
 
369 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21107  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12580  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 
359 aa  229  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.218091 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  45.77 
 
 
588 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  48.44 
 
 
558 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4716  ABC transporter related  49.38 
 
 
271 aa  229  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1303  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 
347 aa  227  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.92932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1092  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.54 
 
 
347 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1237  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 
347 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1104  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  38.54 
 
 
347 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1086  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 
347 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1264  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 
347 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1080  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 
347 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1194  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  38.54 
 
 
347 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1341  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 
347 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000765858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  48.28 
 
 
661 aa  227  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  44.53 
 
 
542 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  47.1 
 
 
561 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0209  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.43 
 
 
331 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.92 
 
 
347 aa  226  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.61652  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  45.59 
 
 
541 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0219  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.25 
 
 
352 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.580766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  47.69 
 
 
571 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  45.32 
 
 
545 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  42.39 
 
 
545 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  47.69 
 
 
550 aa  225  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0982  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.66 
 
 
334 aa  225  8e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  47.49 
 
 
542 aa  225  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4105  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 
347 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  46.04 
 
 
537 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.33 
 
 
703 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3235  ABC peptide transporter, ATPase subunit  41.7 
 
 
282 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0483  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 
340 aa  223  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2096  ABC transporter, ATP-binding protein  45.86 
 
 
328 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001851  oligopeptide transport ATP-binding protein OppD  39.58 
 
 
285 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3972  ABC transporter related  41.7 
 
 
282 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3820  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.75 
 
 
345 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.135433  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  45.42 
 
 
592 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5352  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.01 
 
 
350 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  46.72 
 
 
565 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3966  ABC transporter related  41.7 
 
 
282 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4210  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.39 
 
 
345 aa  223  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3053  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.26 
 
 
330 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.7 
 
 
708 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1673  ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 
328 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.862267  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4761  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.31 
 
 
331 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00642  ABC transporter ATPase component  39.58 
 
 
285 aa  222  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  43.13 
 
 
532 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.81 
 
 
619 aa  222  6e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0944  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.54 
 
 
338 aa  222  6e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  46.07 
 
 
547 aa  222  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01442  D-ala-D-ala transporter subunit  45.49 
 
 
328 aa  221  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.474276  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01454  hypothetical protein  45.49 
 
 
328 aa  221  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.481674  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1569  ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 
328 aa  221  8e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  46.07 
 
 
576 aa  221  9e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.64 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0195088  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4686  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.59 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2439  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.82 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2173  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.49 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2184  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.36 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1689  ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.20752  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1778  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.19 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000196447 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3308  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  41.82 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.64 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.542128  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4792  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.59 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.312785  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
353 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 
544 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  44.93 
 
 
592 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5064  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.84 
 
 
328 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36500  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  45.09 
 
 
332 aa  219  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.632882  normal  0.761775 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.11 
 
 
328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0266217  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  44.19 
 
 
545 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  42.37 
 
 
553 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  47.86 
 
 
546 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  44.57 
 
 
592 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  49.61 
 
 
563 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  42.96 
 
 
542 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  45.14 
 
 
557 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.93 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.743742  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.64 
 
 
584 aa  219  3.9999999999999997e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5622  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.36 
 
 
331 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal  0.711576 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2787  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.69 
 
 
327 aa  219  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1712  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.74 
 
 
320 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000540803  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2602  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.61 
 
 
355 aa  219  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0759  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.23 
 
 
353 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  45.95 
 
 
542 aa  219  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2989  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.61 
 
 
333 aa  219  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  45.95 
 
 
542 aa  218  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1852  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.43 
 
 
325 aa  218  7.999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1406  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  41.18 
 
 
361 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3634  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.68 
 
 
371 aa  218  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187895  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4352  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.06 
 
 
329 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.907997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>