More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl188 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl188  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 180 aa  360  6e-99  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  6.75747e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0205  translation initiation factor IF-3  60 
 
 		 181 aa  239  1e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  45.93 
 
 		 238 aa  153  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  45.09 
 
 		 172 aa  150  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  44.77 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0082  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 		 195 aa  144  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 		 195 aa  144  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 		 195 aa  144  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 		 195 aa  144  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  45.12 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  45.12 
 
 		 166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  45.12 
 
 		 166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  45.73 
 
 		 202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  44.51 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  45.12 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  44.51 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  45 
 
 		 194 aa  142  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  40.99 
 
 		 173 aa  141  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  43.83 
 
 		 170 aa  140  9e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  45.12 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  43.37 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  46.47 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  41.86 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  38.42 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  42.77 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  43.93 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  45.1 
 
 		 154 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0447  translation initiation factor IF-3  44.51 
 
 		 164 aa  136  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  40.24 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  47.85 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  46.24 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  46.58 
 
 		 176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  39.05 
 
 		 219 aa  134  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  41.1 
 
 		 179 aa  134  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  44.3 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  38.89 
 
 		 194 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  38.89 
 
 		 194 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  38.33 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  42.05 
 
 		 176 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  41.24 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0067  translation initiation factor IF-3  44.85 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  40.49 
 
 		 171 aa  131  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  42.44 
 
 		 173 aa  131  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  42.59 
 
 		 169 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 		 198 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  42.07 
 
 		 164 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  41.18 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  41.83 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  41.24 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  38.98 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0708  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00002338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  41.18 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  38.82 
 
 		 154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  42.41 
 
 		 173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  41.21 
 
 		 164 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  40.36 
 
 		 175 aa  128  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  41.77 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  41.62 
 
 		 178 aa  127  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  40.83 
 
 		 198 aa  127  8.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  42.76 
 
 		 154 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  40 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  36 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  42.69 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  47.48 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  37.58 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  39.25 
 
 		 204 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  43.29 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  39.77 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf192  translation initiation factor IF-3  50.67 
 
 		 171 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000290419  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  41.36 
 
 		 173 aa  124  5e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  40.59 
 
 		 173 aa  124  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 		 169 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2146  translation initiation factor IF-3  45.73 
 
 		 173 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000692224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  36.52 
 
 		 178 aa  124  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  40 
 
 		 185 aa  124  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  42.44 
 
 		 173 aa  124  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1858  translation initiation factor IF-3  45.73 
 
 		 173 aa  124  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  41.94 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  44.53 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  39.53 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  37.78 
 
 		 205 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  40.36 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  39.47 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  39.16 
 
 		 178 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  39.26 
 
 		 173 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  38.41 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0329  translation initiation factor IF-3  45.56 
 
 		 172 aa  122  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000359846  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  37.8 
 
 		 177 aa  121  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  39.88 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  42.11 
 
 		 151 aa  121  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  37.93 
 
 		 146 aa  121  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  37.93 
 
 		 222 aa  120  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  38.89 
 
 		 172 aa  120  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  38.29 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  37.65 
 
 		 277 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  40 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>