More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0205 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0205  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
181 aa  364  1e-100  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl188  translation initiation factor IF-3  60 
 
 
180 aa  239  1e-62  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  6.75747e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 
187 aa  143  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  42.48 
 
 
181 aa  135  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  43.86 
 
 
192 aa  136  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  45.73 
 
 
164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 
164 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  43.11 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  41.83 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  43.83 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  39.2 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  37.79 
 
 
238 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  36.42 
 
 
219 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  39.66 
 
 
174 aa  128  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  42.17 
 
 
173 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf192  translation initiation factor IF-3  50.67 
 
 
171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000290419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  39.02 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  39.02 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  37.35 
 
 
172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  39.02 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  39.02 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  39.02 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  39.02 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  39.02 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  39.02 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  45.73 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  39.02 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  39.02 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  41.76 
 
 
173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0082  translation initiation factor IF-3  40 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  39.66 
 
 
194 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  38.55 
 
 
195 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  41.82 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0447  translation initiation factor IF-3  43.9 
 
 
164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472838  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  40.22 
 
 
194 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  41.18 
 
 
176 aa  125  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  40.22 
 
 
194 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  41.46 
 
 
176 aa  124  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  40.13 
 
 
154 aa  124  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  41.18 
 
 
152 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  36.05 
 
 
225 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  39.39 
 
 
198 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  36.21 
 
 
184 aa  122  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  44.19 
 
 
173 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  39.66 
 
 
178 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  38.04 
 
 
179 aa  121  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  38.98 
 
 
178 aa  121  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  41.1 
 
 
171 aa  121  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  39.66 
 
 
204 aa  121  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  44.31 
 
 
176 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  36.2 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  38.27 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  41.72 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  38.95 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  37.8 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  36.81 
 
 
170 aa  119  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  36.02 
 
 
173 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  38.75 
 
 
194 aa  119  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  38.24 
 
 
175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  37.57 
 
 
173 aa  117  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1280  translation initiation factor 3  38.73 
 
 
214 aa  117  6e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.453323  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  42.11 
 
 
151 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  39.51 
 
 
173 aa  117  9e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 
169 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  38.32 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  42.55 
 
 
145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2619  translation initiation factor IF-3  43.53 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  38.82 
 
 
165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  37.91 
 
 
154 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  36.59 
 
 
174 aa  114  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  35.98 
 
 
177 aa  114  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  36.47 
 
 
178 aa  114  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  42.01 
 
 
176 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  36.63 
 
 
173 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  37.14 
 
 
173 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  35.98 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  37.21 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  37.42 
 
 
172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  37.78 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  37.28 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0067  translation initiation factor IF-3  35.76 
 
 
172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  36.36 
 
 
175 aa  111  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  39.31 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0708  translation initiation factor IF-3  43.71 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00002338  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  34.44 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  34.5 
 
 
225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1244  translation initiation factor IF-3  39.88 
 
 
175 aa  109  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000317297  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  35.63 
 
 
176 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  35.63 
 
 
173 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1858  translation initiation factor IF-3  43.64 
 
 
173 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  35.63 
 
 
173 aa  108  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1772  translation initiation factor IF-3  39.29 
 
 
200 aa  107  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000139127  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1738  translation initiation factor IF-3  39.29 
 
 
200 aa  107  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  35.09 
 
 
219 aa  107  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1509  translation initiation factor IF-3  38.16 
 
 
204 aa  107  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00441613  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  35.06 
 
 
173 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1768  translation initiation factor IF-3  36.36 
 
 
221 aa  107  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2146  translation initiation factor IF-3  43.03 
 
 
173 aa  107  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000692224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>