More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1121 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1121  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 247 aa  486  1e-136  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  39.47 
 
 		 112 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  34.48 
 
 		 121 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  40.35 
 
 		 112 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1480  nitrogen regulatory protein P-II  40.35 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  41.84 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  40.35 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  36.21 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  38.78 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  39.8 
 
 		 112 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  41.41 
 
 		 112 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  33.62 
 
 		 112 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  39.47 
 
 		 112 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0850  nitrogen regulatory protein P-II  31.9 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  41 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2086  nitrogen regulatory protein P-II  32.52 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2462  nitrogen regulatory protein P-II 1  32.52 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.172817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  34.48 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  42.42 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  39.47 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2893  nitrogen regulatory protein P-II  34.4 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0162783  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  36.36 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  33.62 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  31.9 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1123  nitrogen regulatory protein P-II  40.21 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.727128  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  40.21 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  41.41 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  37.37 
 
 		 112 aa  62  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0470  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 		 112 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.933186  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  41 
 
 		 112 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2577  nitrogen regulatory protein P-II  36.54 
 
 		 122 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  40.4 
 
 		 112 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  35.34 
 
 		 113 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  39.39 
 
 		 112 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3237  nitrogen regulatory protein P-II  38.38 
 
 		 112 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  34.23 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  39.39 
 
 		 116 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1481  nitrogen regulatory protein P-II  38.6 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0033  nitrogen regulatory protein P-II  38.78 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  36.52 
 
 		 112 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  33.91 
 
 		 112 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  36.08 
 
 		 110 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0742  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2055  nitrogen regulatory protein P-II  30.95 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  39.39 
 
 		 116 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  38.14 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  40.4 
 
 		 112 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  39.39 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  31.9 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  40.82 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  38.14 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  40.21 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  37.37 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  31.9 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  38.38 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1020  nitrogen regulatory protein P-II  32.76 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.852949  normal  0.847893 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  35.05 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  35.96 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  34.34 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  37.11 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  37.37 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  34.21 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0018  nitrogen regulatory protein P-II  37.76 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.825328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  31.9 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  31.9 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  37.37 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  35.9 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  38.14 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.11 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4445  nitrogen regulatory protein P-II, GlnB, GlnK  33.93 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  34.21 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  37.37 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  35.05 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  37.37 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  34.02 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  34.31 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  35.05 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  33.91 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  35.09 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  32.76 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1304  nitrogen regulatory protein P-II  38.14 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774193  normal  0.209326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  37.11 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  39 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  39 
 
 		 112 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  31.9 
 
 		 112 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  38.39 
 
 		 112 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 		 112 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  38.39 
 
 		 112 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  38.14 
 
 		 112 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  34.21 
 
 		 112 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0277  nitrogen regulatory protein P-II  41.24 
 
 		 112 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  39 
 
 		 112 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  39 
 
 		 112 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  35.09 
 
 		 112 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  39.39 
 
 		 112 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  39 
 
 		 112 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  36.08 
 
 		 112 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>