More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2055 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2055  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 130 aa  258  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2530  nitrogen regulatory protein P-II  62.07 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.18925  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0900  nitrogen regulatory protein P-II  58.97 
 
 		 117 aa  139  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0013  nitrogen regulatory protein P-II  59.13 
 
 		 116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271001  normal  0.0615385 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0115  nitrogen regulatory protein P-II  58.62 
 
 		 116 aa  137  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0778651  normal  0.359579 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0129  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0837985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  47.32 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  47.32 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  52.59 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.11 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  47.32 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0470  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.933186  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.64 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 114 aa  103  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  45.54 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  43.75 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  44.64 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>